百趣土壤非靶标代谢组学文献分享，来自Microbiome的灵感

​今天小编要和大家分享的是BIOTREE协助客户发表在Microbiome上的关于土壤抗性遗传的一篇文章。

 发表期刊：《Microbiome》

影响因子：9.133

合作单位：南京农业大学

据百趣代谢组学小趣了解，植物方面的高分文章并不好发，那这篇文章到底做了啥？竟能发到影响因子为9.133的期刊！快来看看原因吧!

1百趣代谢组学文献分享-研究背景

自然界中，植物会不断地受到各种微生物病原体的攻击和侵染，但我们都知道世间万物，相生相克，总是一物降一物，所以即使在病原体存在和有利于疾病发展的气候条件下，一些土壤也具有抑制植物病害的能力。

据报道，这种天然抑病土壤可用于各种农作物的疾病预防，例如小麦立枯病、马铃薯疮痂病和香草枯萎病等。有人认为这种土壤的抑病作用与土壤中特定微生物的丰度有关，即高丰度有益微生物可以通过产生抗菌化合物直接抑制病原体，也可通过刺激植物的免疫系统间接抑制病原体，这种现象称为诱导系统抗性（ISR）。

土壤非靶代谢组学，那抑病土壤中的高丰度有益微生物是怎么来的呢？前人提出了“求救”假设，即植物在受到攻击和侵染时，会富集和维持特定的有益微生物，从而使得土壤中这种抑病的“特异功能”得以传承。

不过也有人认为植物根系分泌物和其他根源分子在其中起到了作用，那到底是什么在其中发挥了作用？还是都有参与呢？大家在里面又都扮演着什么样的角色呢？下面百趣代谢组学小趣为大家解开谜底！

2研究方法

这篇文章通过在同一土壤中连续种植五代拟南芥来调节土壤。土壤非靶代谢组学，在每一代中，用丁香假单胞番茄致病变种DC3000（简称Pst）侵染拟南芥叶片作为病原条件组，无菌水接种的作为对照组，通过这种方式构建病原体条件土壤和对照条件土壤，整个实验设计可见图1。