Python34 遗传算法Genetic Algorithm (GA)

1. 发展历史

遗传算法(Genetic Algorithm, GA)是一种受自然选择和遗传学启发的优化算法。它最早由美国学者John Holland在20世纪70年代提出,旨在研究自然系统中的适应性,并应用于计算机科学中的优化问题。

关键发展历程
  • 1975年: John Holland在其著作《Adaptation in Natural and Artificial Systems》中首次提出遗传算法的概念。

  • 1980年代: 遗传算法开始应用于函数优化、组合优化等领域,逐渐受到关注。

  • 1990年代: 随着计算机计算能力的提升,遗传算法在工程、经济学、生物学等领域得到广泛应用。

  • 2000年代至今: 遗传算法的理论和应用进一步发展,出现了多种改进算法,如遗传编程(Genetic Programming)、差分进化(Differential Evolution)等。

2. 数学原理

遗传算法是一种基于自然选择和遗传学的随机搜索方法,其基本思想是模拟生物进化过程,通过选择交叉变异操作,不断产生新一代种群,从而逐步逼近最优解。

遗传算法的基本步骤
  1. 初始化: 随机生成初始种群。

  2. 选择: 根据适应度函数选择较优个体。

  3. 交叉: 通过交换父代个体的部分基因产生新个体。

  4. 变异: 随机改变个体的部分基因。

  5. 迭代: 重复选择、交叉、变异过程,直到满足终止条件。

数学描述

假设种群大小为N,每个个体的染色体长度为L,遗传算法的数学过程如下:

  1. 初始化: 生成种群 ,其中  为染色体。

  2. 适应度计算: 计算每个个体的适应度值 。

  3. 选择: 根据适应度值选择个体,常用方法有轮盘赌选择、锦标赛选择等。

  4. 交叉: 选取部分个体进行交叉操作,产生新个体 。

  5. 变异: 对部分新个体进行变异操作,产生变异个体 。

  6. 更新种群: 用新个体替换旧个体,形成新一代种群 。

  7. 终止条件: 若达到预设的终止条件(如迭代次数或适应度阈值),则输出最优解。

3. 应用场景

遗传算法因其适应性和鲁棒性,在多种领域得到了广泛应用:

工程优化
  • 结构优化: 设计轻量化和高强度的结构。

  • 参数优化: 调整系统参数以达到最佳性能。

经济学与金融
  • 投资组合优化: 分配投资资产以最大化收益。

  • 市场预测: 预测股票价格和市场趋势。

生物信息学
  • 基因序列比对: 进行DNA序列的比对和分析。

  • 蛋白质结构预测: 预测蛋白质的三维结构。

机器学习
  • 神经网络训练: 优化神经网络的权重和结构。

  • 特征选择: 选择最有利于分类或回归的特征。

4. 可视化实现Python实例

图片

以下代码示例实现了一个解决旅行商问题的遗传算法。旅行商问题(TSP)是一个经典的组合优化问题,旨在找到一个旅行商从一组给定城市中的每一个城市恰好访问一次,并最终回到起始城市的最短路径,即最小化总旅行距离或成本,广泛应用于物流、生产调度等领域。

我们首先定义中国所有省会城市(包含中国台湾省省会台北)及其坐标的数据,并使用哈夫曼公式计算两点间的距离,然后通过遗传算法创建初始种群,进行繁殖、突变和生成下一代,不断优化路径,最终记录每一代中最短路径的距离和对应的路径,并在所有迭代中找到最短路径,在地图上可视化展示所有城市位置适应度随迭代次数变化以及最优路径,最终结果展示了从重庆出发经过所有城市的最短路径及其总距离。总共训练两次,第一次迭代次数为2000次,运行时间约为3分钟,第二次设置迭代次数20000次,运行时间大概在15分钟左右。

用一句话总结:从重庆出发,游遍中国所有的省会城市,利用遗传算法寻找到最短路径。以下是代码实现:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.basemap import Basemap
import random
from math import radians, sin, cos, sqrt, atan2

# 设置随机种子以保证结果可重复
random.seed(42)
np.random.seed(42)

# 定义城市和坐标列表,包括台北
cities = {
    "北京": (39.9042, 116.4074
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