单晶XRD测试常见问题(一)

本文详细解答了单晶X射线衍射测试中的常见问题,如晶体挑选、靶材选择、温度控制、数据类型、多晶与单晶的区别等,以及注意事项和工具使用技巧。科学指南针提供了全国服务网络和技术支持。

在做单晶X射线衍射(单晶XRD)测试时,科学指南针工作人员在与很多同学沟通中了解到,好多同学对单晶XRD不太了解,针对此,科学指南针团队组织相关同事对网上单晶xrd常见问答进行整理,希望可以帮助到科研圈的伙伴们。


1.怎么分辨晶体能否测试?

答:晶体是要规则,无明显裂纹的晶体(且晶体不小于20微米)。


2.怎么选择合适的靶材?

答:一般含有金属原子的,优先选择钼靶测试。纯有机的,可能要选择铜靶。


3.什么时候选择常温或者低温?

答:这个要拿到晶体测试后,才能确定。一般有机和MOF类可能需要选择低温。


4.如果只解析晶体结构,需要提供的数据类型有哪些?

答:要提供.raw, .hkl, .p4p,._ls类型的文件,有时候也需要原始衍射图,结构式。


5.长出来的晶体怎么区别是单晶还是多晶?两者区别是什么?

答:把晶体挑选出来进行测试,单晶和多晶的衍射图谱不一样。单晶的衍射图谱(左图)是一个个独立的衍射点,而多晶的衍射图谱(右图)是一个个环。

6.蛋白单晶我一个月都没有,还是一些絮状物,该不该重新做?

答:絮状物大部分不是晶体,测试时没有衍射点。建议重新设置条件进行培养。


7.除了CCDC数据库,最新文献的单晶结果可以参考吗?是不是文献的可靠性不如数据库的高啊?

答:最新的单晶文献可以参考。可靠性,两者是一样的。但是数据库的信息比文献要全面些,建议把晶胞参数输入数据库里进行比对。

8.单晶研磨之后,晶体结构没有改变,还是原来的,但是肯定变成了多晶了啊,这样测试物相是啥没问题,但是不能反应晶体学取向了吧?那我单晶不研磨直接测试可以吗?

答:这个要看测试目的。如果是需要得到样品的纯度,建议把样品研磨成粉末进行测试。如果是需要看晶体的生长取向,建议直接用单晶样品进行测试。


9.请问一下我用CIFTOOLs导出来的晶体数据中没有氢键的数据,这是前面解析的过程中需要处理的呢?还是我这个物质中没有氢键呢?

答:氢键的计算是需要在命令区加个指令HTAB,一般格式是HTAB 给体原子受体原子。如下图所示

10.老师,我是做蛋白单晶的,今天讲的单晶解析可以用于蛋白解析么?

答:单晶解析包括空间群的确定、找粗结构和精修结构。每步里面的解析思路是适用于任何晶体的。

11.我们输入size命令后,size后那几个数字是从哪里看来的?

答:这个尺寸在单晶测试时,由仪器可以评估出长宽高。

12.精修轮数是先按照经验确定后再实际精修的吗?

答:精修轮数L.S.,一般按照经验来定,一般定为L.S. 8或10。

科学指南针通过互联网技术建立更可靠的服务标准,全国26个办事处,12个城市拥有自营实验室,最好的设备、最专业的老师为您服务。

免责声明:部分文章整合自网络,因内容庞杂无法联系到全部作者,如有侵权,请联系删除,我们会在第一时间予以答复,万分感谢。

更多科研干货教程,可以点击下面链接获取哦~

单晶XRD

考虑柔性负荷的综合能源系统低碳经济优化调度【考虑碳交易机制】(Matlab代码实现)内容概要:本文围绕“考虑柔性负荷的综合能源系统低碳经济优化调度”展开,重点研究在碳交易机制下如何实现综合能源系统的低碳化与经济性协同优化。通过构建包含风电、光伏、储能、柔性负荷等多种能源形式的系统模型,结合碳交易成本与能源调度成本,提出优化调度策略,以降低碳排放并提升系统运行经济性。文中采用Matlab进行仿真代码实现,验证了所提模型在平衡能源供需、平抑可再生能源波动、引导柔性负荷参与调度等方面的有效性,为低碳能源系统的设计与运行提供了技术支撑。; 适合人群:具备定电力系统、能源系统背景,熟悉Matlab编程,从事能源优化、低碳调度、综合能源系统等相关领域研究的研究生、科研人员及工程技术人员。; 使用场景及目标:①研究碳交易机制对综合能源系统调度决策的影响;②实现柔性负荷在削填谷、促进可再生能源消纳中的作用;③掌握基于Matlab的能源系统建模与优化求解方法;④为实际综合能源项目提供低碳经济调度方案参考。; 阅读建议:建议读者结合Matlab代码深入理解模型构建与求解过程,重点关注目标函数设计、约束条件设置及碳交易成本的量化方式,可进步扩展至多能互补、需求响应等场景进行二次开发与仿真验证。
### 单晶X射线衍射(XRD)数据分析 单晶X射线衍射法是种用于解析晶体结构的强大工具,其核心在于通过测量单晶样品对X射线的衍射强度来推导原子的位置和排列方式。以下是关于如何进行单晶X射线衍射数据处理的关键步骤和技术要点: #### 数据收集 在实验过程中,通常会将单晶样品置于X射线衍射仪中心并暴露于X射线下[^2]。随后记录下衍射图案中的各个反射点及其对应的强度值。 #### 初步处理与校正 原始采集的数据需经过系列预处理操作才能进步分析: - **背景扣除**:去除由于仪器噪声或其他因素引起的非信号部分。 - **吸收修正**:补偿因X射线穿过样本内部路径长度差异而产生的影响。 这些初步调整有助于提高最终模型精度[^1]。 #### 结构解决与精修 利用专门软件包(如SHELXTL、CIFDEPOT等),可以基于已知空间群假设尝试构建初始分子几何形状;之后采用最小二乘拟合法不断优化参数直至获得满意残差水平为止。此阶段涉及多个重要方面包括但不限于: - 确定合适的起点坐标系; - 调整各向异性位移因子以反映真实热振动模式; - 验证所得结果合理性并通过R-factor指标评估质量标准。 ```python from cctbx import sgtbx, uctbx import iotbx.cif.model as cif_model def load_cif(file_path): """Load CIF file.""" data_blocks = cif_model.read_file(file_path).data_blocks return data_blocks[0] cif_data = load_cif('example.cif') space_group_symbol = cif_data['_symmetry.space_group_name_H-M'] unit_cell_parameters = [float(cif_data[key]) for key in ['_cell.length_a', '_cell.length_b', '_cell.length_c', '_cell.angle_alpha', '_cell.angle_beta', '_cell.angle_gamma']] space_group_info = sgtbx.space_group_info(symbol=space_group_symbol) unit_cell = uctbx.unit_cell(unit_cell_parameters) print(f'Space Group: {space_group_info.type().lookup_symbol()}') print(f'Unit Cell Parameters: {unit_cell.parameters()}') ``` 上述脚本展示了加载`.cif`文件并提取基本信息的个简单例子[^3]。 #### 可视化展示 完成全部计算流程后,往往还需要借助图形界面程序(例如Mercury 或 Jmol)直观呈现三维立体图像效果以便更好地理解复杂体系内的相互作用关系[^5]。 ---
评论
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
红包 添加红包
表情包 插入表情
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值