一文读懂长非编码RNA(lncRNA)的分类、功能及测序鉴定方法

本文详细介绍了长非编码RNA(lncRNA)的定义、分类、主要功能,以及通过RNA-seq等方法进行鉴定的策略。lncRNA在生物学过程中扮演重要角色,与多种疾病相关,其组织特异性表达增加了研究价值。

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RNA的重要调控功能发现历程(Rinn et al. Annu Rev Biochem, 2013)


长非编码RNA,英文名为long noncoding RNAs,缩写为lncRNA,是指长度大于200 核苷酸的非编码RNA。LncRNA因具有非常重要的调控功能,且几乎参与到了各种生物学过程和通路,与各种疾病的发生发展紧密关联,从而成为过去几年和将来的研究热点和重点。对于人类基因组来说,产生的lncRNA数量比编码RNA的数量要多得多,目前除了少数lncRNA的功能比较明确外,大部分lncRNA的功能都还未知。非常值得去深入研究。


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根据基因组上的位置关系,lncRNA主要可以分为以下三大类(如下图所示):

1、Intronic lncRNA,内含子lncRNA:主要产生于编码基因的内含子区域;

2、Intergenic lncRNA,基因间区的lncRNA,也称作lincRNA:主要产生于两个编码基因的中间区域;

3、Antisense lncRNA,

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