zhanghongyi_cpp的博客

在安装stringtie时，软件会自带一个名为“prepDEpy”的脚本，将这个脚本文件放在刚才保存的文件夹外部，运行这个py脚本，即可得到这一系列样本的基因表达数据“gene_count_matrix.csv”和“transcript_count_matrix.csv”，其中“gene_count_matrix.csv”将会在后续处理中使用到。将所有样本处理完之后得到多个“stringtie”处理后的文件群，在处理过程中需要将不同样本经过stringtie处理得到的文件群保存到独立的文件夹中。