机器学习在生物信息学研究中的影响
生物信息学在当今生命科学领域扮演着至关重要的角色,而机器学习的融入更是为其发展注入了新的活力。本文将深入探讨生物信息学的相关概念、机器学习在其中的应用,以及生物数据库的发展和序列数据分析方法,并以 BLAST 算法为例进行详细剖析。
1. 生物信息学与机器学习概述
1.1 生物信息学的定义与领域融合
生物信息学由 Paulien Hogeweg 和 Ben Hesper 提出,它整合了多个领域的经典特征,主要包括:
- 生物学 :在捕捉生物数据的正确模板方面发挥着显著作用。
- 信息工程 :有助于生物数据信息的生成、分发,并对其进行分析。
- 计算机科学 :促进过程与数据之间的交互。
- 数学和统计学 :协助进行所有必要的数学运算、详细研究,并描绘生物数据。
生物信息学是一门聚合、存储、检索和分析生物数据的科学,还能帮助开发软件工具,以全面了解生物数据。生物数据主要涵盖基因组学、蛋白质组学、微阵列、系统生物学、进化和文本挖掘等方面。
1.2 机器学习在生物信息学中的作用
近年来,来自神经科学等各种来源的生物数据量巨大,传统的生物信息学方法在处理速度和人力方面存在限制,因此需要依靠机器学习。机器学习包含多种重要技术,通过使用多样化的算法进行数据分析和预测,助力生物信息学研究。其基本原理是将生物数据集输入系统,训练系统可靠地区分数据集并进行预测。机器学习算法能让系统从先前记录的生物数据集(如基因
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