曼哈顿图如何指定不同染色体不同的颜色

大家好，我是邓飞，最近星球（飞哥的知识）有老师问了一个问题：

GAPIT软件，染色体的颜色是5个一循环，他有12个染色体，想每条染色体一个颜色绘制一条染色体：

我的回答：GAPIT大概率没有参数设置，但是可以把结果文件用CMplot进行可视化，这个肯定是没问题的，我回头写篇博客。那么，博客来了：

1，数据

library(CMplot)data("pig60K")
# 挑选10000个位点library(tidyverse)set.seed(123)dd = pig60K %>% sample_n(10000)dd1  = dd %>% filter(Chromosome %in% 1:12)dd1 %>% count(Chromosome)head(dd1)

使用CMplot软件包的数据，提取12条染色体作为演示：