3 系统树

3 系统树

系统树：描述基因，个体，种群，物种，或种上之间系统发生关系假说的树状图。
系统树的要素：分支型式（括扑结构） 分枝长度 树根 内部节点 外部节点、
分支型式（括扑结构）:系统树最重要的特征。指分类单元在系统树上的分支情况，各分支的排列及相对位置。
内部节点 外部节点：系统树的节点
分枝长度：进化时间与进化速率的乘积（b=r * t）
**注意：**不同数据类型之间没有可比性
生物演化历史（evolutionary history）新物种形成和已有物种灭绝
冠群（crown taxa/group）：现有物种
基群（stem taxa/group）：化石类群（灭绝）
总群：冠群+基群
系统树表达的生物类群的关系：1 祖裔关系 2 相对祖先近度关系 3 姐妹群关系 4 相对进化速率关系 5 分歧年代关系

系统树的类型

树状图 网状图
有根树 无根树
基因树 物种树
分支（clade）单系群 多系群 并系群