MySQL单机多实例方案

CPU处理器NUMA架构简介 在实际工作中,经常遇到服务器是否开启NUMA、NUMA绑定几颗Core、跨NUMA节点访问的性能下降等等话题。那么NUMA作为非一致性内存访问的多处理器架构,在架构上有什么特性、与SMP架构有哪些不同,调优策略等,本文将作简要介绍。 阅读详情

MySQL单机多实例方案,是指在一台物理的PC服务器上运行多个MySQL数据库实例,为什么要这样做?这样做的好处是什么?

1.存储技术飞速发展,IO不再是瓶颈

普通PC服务器的CPU与IO资源不均衡,因为磁盘的IO能力非常有限,为了满足应用的需要,往往需要配置大量的服务器,这样就造成CPU资源的大量浪费。但是,Flash存储技术的出现改变了这一切,单机的IO能力不再是瓶颈,可以在单机运行多个MySQL实例提升CPU利用率。

2.MySQL对多核CPU利用率低

MySQL对多核CPU的利用率不高,一直是个问题,5.1版本以前的MySQL,当CPU超过4个核时,性能无法线性扩展。虽然MySQL后续版本一直在改进这个问题,包括Innodb plugin和Percona XtraDB都对多核CPU的利用率改进了很多,但是依然无法实现性能随着CPU core的增加而提升。我们现在常用的双路至强服务器,单颗CPU有4-8个core,在操作系统上可以看到16-32 CPU(每个core有两个线程),四路服务器可以达到64 core甚至更多,所以提升MySQL对于多核CPU的利用率是提升性能的重要手段。下图是Percona的一份测试数据:

3.NUMA对MySQL性能的影响

我们现在使用的PC服务器都是NUMA架构的,下图是Intel 5600 CPU的架构:

NUMA的内存分配策略有四种:

1.缺省(default):总是在本地节点分配(分配在当前进程运行的节点上);

2.绑定(bind):强制分配到指定节点上;

3.交叉(interleave):在所有节点或者指定的节点上交织分配;

4.优先(preferred):在指定节点上分配,失败则在其他节点上分配。

因为NUMA默认的内存分配策略是优先在进程所在CPU的本地内存中分配,会导致CPU节点之间内存分配不均衡,当某个CPU节点的内存不足时,会导致swap产生,而不是从远程节点分配内存。这就是所谓的swap insanity现象。

MySQL采用了线程模式,对于NUMA特性的支持并不好,如果单机只运行一个MySQL实例,我们可以选择关闭NUMA,关闭的方法有三种:1.硬件层,在BIOS中设置关闭;2.OS内核,启动时设置numa=off;3.可以用numactl命令将内存分配策略修改为interleave(交叉),有些硬件可以在BIOS中设置。

如果单机运行多个MySQL实例,我们可以将MySQL绑定在不同的CPU节点上,并且采用绑定的内存分配策略,强制在本节点内分配内存,这样既可以充分利用硬件的NUMA特性,又避免了单实例MySQL对多核CPU利用率不高的问题。

资源隔离方案

1.CPU,Memory

numactl –cpubind=0 –localalloc,此命令将MySQL绑定在不同的CPU节点上,cpubind是指NUMA概念中的CPU节点,可以用numactl –hardware查看,localalloc参数指定内存为本地分配策略。

2.IO

我们在机器中内置了fusionio卡(320G),配合flashcache技术,单机的IO不再成为瓶颈,所以IO我们采用了多实例共享的方式,并没有对IO做资源限制。多个MySQL实例使用相同的物理设备,不同的目录的来进行区分。

3.Network

因为单机运行多个实例,必须对网络进行优化,我们通过多个的IP的方式,将多个MySQL实例绑定在不同的网卡上,从而提高整体的网络能力。还有一种更高级的做法是,将不同网卡的中断与CPU绑定,这样可以大幅度提升网卡的效率。

4.为什么不采用虚拟机

虚拟机会耗费额外的资源,而且MySQL属于IO类型的应用,采用虚拟机会大幅度降低IO的性能,而且虚拟机的管理成本比较高。所以,我们的数据库都不采用虚拟机的方式。

5.性能

下图是Percona的测试数据,可以看到运行两个实例的提升非常明显。

高可用方案

因为单机运行了多个MySQL实例,所以不能采用主机层面的HA策略,比如heartbeat。因为当一个MySQL实例出现问题时,无法将整个机器切换。所以必须改为MySQL实例级别的HA策略,我们采用了自己开发的MySQL访问层来解决HA的问题,当某个实例出问题时,只切换一个实例,对于应用来说,这一层是透明的。

MySQL单机多实例方案的优点

1.节省成本,虽然采用Flash存储的成本比较高,但是如果可以缩减机器的数量,考虑到节省电力和机房使用的成本,还是比单机单实例的方案更便宜。

2.提升利用率,利用NUMA特性,将MySQL实例绑定在不同的CPU节点,不仅提高了CPU利用率,同时解决了MySQL对多核CPU的利用率问题。

3.提升用户体验,采用Flash存储技术,大幅度降低IO响应时间,有助于提升用户的体验。


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B. Palm", title = "Prediction as a candidate for learning deep hierarchical models of data", year = "2012",}```Contact: rasmusbergpalm at gmail dot comDirectories included in the toolbox-----------------------------------`NN/` - A library for Feedforward Backpropagation Neural Networks`CNN/` - A library for Convolutional Neural Networks`DBN/` - A library for Deep Belief Networks`SAE/` - A library for Stacked Auto-Encoders`CAE/` - A library for Convolutional Auto-Encoders`util/` - Utility functions used by the libraries`data/` - Data used by the examples`tests/` - unit tests to verify toolbox is workingFor references on each library check REFS.mdSetup-----1. Download.2. addpath(genpath('DeepLearnToolbox'));Example: Deep Belief Network---------------------```matlabfunction test_example_DBNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit RBM and visualize its weightsrand('state',0)dbn.sizes = [100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);figure; visualize(dbn.rbm{1}.W'); % Visualize the RBM weights%% ex2 train a 100-100 hidden unit DBN and use its weights to initialize a NNrand('state',0)%train dbndbn.sizes = [100 100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);%unfold dbn to nnnn = dbnunfoldtonn(dbn, 10);nn.activation_function = 'sigm';%train nnopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.10, 'Too big error');```Example: Stacked Auto-Encoders---------------------```matlabfunction test_example_SAEload mnist_uint8;train_x = double(train_x)/255;test_x = double(test_x)/255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit SDAE and use it to initialize a FFNN% Setup and train a stacked denoising autoencoder (SDAE)rand('state',0)sae = saesetup([784 100]);sae.ae{1}.activation_function = 'sigm';sae.ae{1}.learningRate = 1;sae.ae{1}.inputZeroMaskedFraction = 0.5;opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;sae = saetrain(sae, train_x, opts);visualize(sae.ae{1}.W{1}(:,2:end)')% Use the SDAE to initialize a FFNNnn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm';nn.learningRate = 1;nn.W{1} = sae.ae{1}.W{1};% Train the FFNNopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.16, 'Too big error');```Example: Convolutional Neural Nets---------------------```matlabfunction test_example_CNNload mnist_uint8;train_x = double(reshape(train_x',28,28,60000))/255;test_x = double(reshape(test_x',28,28,10000))/255;train_y = double(train_y');test_y = double(test_y');%% ex1 Train a 6c-2s-12c-2s Convolutional neural network %will run 1 epoch in about 200 second and get around 11% error. %With 100 epochs you'll get around 1.2% errorrand('state',0)cnn.layers = { struct('type', 'i') %input layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 6, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %sub sampling layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 12, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %subsampling layer};cnn = cnnsetup(cnn, train_x, train_y);opts.alpha = 1;opts.batchsize = 50;opts.numepochs = 1;cnn = cnntrain(cnn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = cnntest(cnn, test_x, test_y);%plot mean squared errorfigure; plot(cnn.rL);assert(er<0.12, 'Too big error');```Example: Neural Networks---------------------```matlabfunction test_example_NNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);% normalize[train_x, mu, sigma] = zscore(train_x);test_x = normalize(test_x, mu, sigma);%% ex1 vanilla neural netrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samples[nn, L] = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.08, 'Too big error');%% ex2 neural net with L2 weight decayrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.weightPenaltyL2 = 1e-4; % L2 weight decayopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex3 neural net with dropoutrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.dropoutFraction = 0.5; % Dropout fraction opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex4 neural net with sigmoid activation functionrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm'; % Sigmoid activation functionnn.learningRate = 1; % Sigm require a lower learning rateopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex5 plotting functionalityrand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]);opts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through datann.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex6 neural net with sigmoid activation and plotting of validation and training error% split training data into training and validation datavx = train_x(1:10000,:);tx = train_x(10001:end,:);vy = train_y(1:10000,:);ty = train_y(10001:end,:);rand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]); nn.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, tx, ty, opts, vx, vy); % nntrain takes validation set as last two arguments (optionally)[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');```[![Bitdeli Badge](https://d2weczhvl823v0.cloudfront.net/rasmusbergpalm/deeplearntoolbox/trend.png)](https://bitdeli.com/free "Bitdeli Badge")

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