高性能计算与医学图像重建的并行化探索
在高性能计算领域,不同的编程语言和架构在实现并行计算方面有着各自的特点和优势。同时,在医学图像重建领域,并行化技术对于提高算法效率和实现临床应用至关重要。下面将分别介绍高性能计算中的相关语言和架构,以及医学图像重建中并行化算法的实现。
高性能计算中的语言与架构
在高性能计算中,有多种技术可用于生成高度可并行化的代码,主要包括以下三种:
1. 显式并行编程 :仔细确定运行的并行方式并显式编写代码,常用的有消息传递接口 API(如 MPI)和线程库(如 Pthreads)。
2. 源代码注解或指令 :为编译器提供信息,指示执行的并行方式。
3. 自动并行化 :编译器通过分析变量之间的依赖关系来自动并行化代码。
以下是一些相关语言和架构的介绍:
- SaC 语言 :作为一种函数式、单赋值语言,SaC 编译器能够进行一些独特的优化。它可以将数组上的许多小操作合并为更少的大操作,从而使程序能够更好地扩展。在并行架构上,用 SaC 编写的高性能应用程序能够实现加速。例如,在一个较大的 2000x2000 网格基准测试中,Fortran 在核心数量较少时能有一定的扩展,但超过五个核心后,就会受到线程间通信开销的影响。而 SaC 则能更好地识别每个依赖关系,实现更高效的并行计算。
- High-Performance Fortran :是 FORTRAN - 90 的扩展,允许在源代码中添加指令来注释分布和局部性。Fort
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