linux服务器上安装IGV,并在windows系统中进行可视化操作(CentOS)

本文介绍了如何在Windows系统上通过XMING和Xshell工具,实现对Linux服务器上大型测序数据的igv可视化,包括下载安装XMING,配置Xshell,以及Linux服务器上的igv安装和启动方法。

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【Backgrounds】在使用igv时,我们的测序数据可能非常大,可能有几百个GB,传输到window电脑上非常耗时,而且不一定能带动。所以我们可以在Linux中安装一个igv,并在windows系统中进行可视化操作会方便很多。

1. 下载和安装XMING

1.1 下载XMING

使用windows的电脑下载XMING,链接如下:

https://sourceforge.net/projects/xming/

1.2 安装XMING

首先点击xxx.setup.exe文件进入安装界面,直接按照默认的来,也可以选择安装目录进行自定义安装,最后可以选择桌面快捷方式。安装完毕后,会有两个快捷方式的图标,一个是Xming,一个是Xlaunch,如果你安装的时候没有勾选创建快捷方式,就在安装目录中找。
在这里插入图片描述
第二步,先点开Xlaunch,会显示一个display number,我这方框里面是0,记住它,后面配置xshell的时候有用。然后一直默认下一步,直到完成。

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