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原创 解图-1-QQ-plot
QQ图(Quantile-Quantile Plot)是一种用于评估观察数据与理论分布差异的可视化工具,在GWAS(全基因组关联分析)中尤为重要。
2025-05-21 20:02:59
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原创 生信小白学Rust-02
(如果你要改变,就要重新创建一个新的变量,这里涉及到内存对象的再分配)。使用较小的数据结构时,通常创建新的实例并以更具函数式的风格来编写程序,可能会更容易理解,所以值得以较低的性能开销来确保代码清。前文提到,这是 Rust 团队为我们精心设计的语言特性之一,让我们编写的代码更安全,性能也更好。,这样后续的赋值操作就合法了。变量遮蔽:在Rust中,使用let关键字重新声明同名变量会创建一个全新的变量,完全遮蔽之前的变量。这个新的 x 是可变的(mut),所以后续的 x = 6 赋值操作是合法的。
2025-04-16 23:11:20
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原创 生物信息Rust-01
一直想多学一门编译语言,主要有几个原因吧(1. 看到一位老师实验室要求需要掌握一门编译语言;2. 自己享想试着开发一些实用的生信工具,感觉自己现在相比于数据分析,探索生物学层面的意义相比更想做一些实用性的东西出来),之前在C、C++、Rust之间摇摆,一直没有行动起来学,确实也怪自己拖延。直到前段时间,想去的那个实验室发了一篇很有创新性的文章,又勾起了我想前往深造的想法。(叠个甲,不是只想着为了发文章才去,而是觉得在那里会有更多的可能性。
2025-04-12 23:48:06
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原创 【Nature官方指南:科研人必备的5大AI神器,选对工具效率翻倍!】
每周都有新AI工具轰炸学术界,ChatGPT已过时?Nature最新测评揭秘:这5款工具才是科研人的「外挂大脑」!
2025-02-17 23:48:07
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原创 Bio-Info每日一题:Rosalind-08-Translating RNA into Protein(RNA翻译蛋白质)
生物信息学?听起来很高级,但其实,它是一场 DNA 和计算机的跨界恋爱!今天,我们来认识一位改变世界的 "生信小伙伴":Rosalind。无论你是个只会数 0 和 1 的程序员,还是只看 DNA 觉得 "A=T,C=G" 的小白,这个平台都会让你分分钟上瘾!🤓。
2024-11-21 10:34:32
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原创 Bio-Info每日一题:Rosalind-07-Mendel‘s First Law(孟德尔第一定律 python实现)
🎉 进入生物信息学的世界,与Rosalind一起探索吧!🧬Rosalind是一个在线平台,专为学习和实践生物信息学而设计。该平台提供了一系列循序渐进的编程挑战,帮助用户从基础到高级掌握生物信息学知识。无论你是初学者还是专业人士,Rosalind都能为你提供适合的学习资源和实践机会。你是否想像专业人士一样分析DNA序列?这里有一个简单的任务来帮助你入门。📝这个题目是要你计算在一群具有不同基因型的个体中,两两随机交配后,后代中表现显性性状的概率。
2024-06-16 15:00:32
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原创 Bio-Info每日一题:Rosalind-06-Counting Point Mutations
Rosalind是一个在线平台,专为学习和实践生物信息学而设计。该平台提供了一系列循序渐进的编程挑战,帮助用户从基础到高级掌握生物信息学知识。无论你是初学者还是专业人士,Rosalind都能为你提供适合的学习资源和实践机会。(英语:Hamming distance)是两个字符串对应位置的不同字符的个数。换句话说,它就是将一个字符串变换成另外一个字符串所需要替换的字符个数。你是否想像专业人士一样分析DNA序列?这里有一个简单的任务来帮助你入门。🎉 进入生物信息学的世界,与Rosalind一起探索吧!
2024-06-10 20:56:31
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原创 Bio-Info每日一题:Rosalind-05-Computing GC Content
🎉 进入生物信息学的世界,与Rosalind一起探索吧!🧬Rosalind是一个在线平台,专为学习和实践生物信息学而设计。该平台提供了一系列循序渐进的编程挑战,帮助用户从基础到高级掌握生物信息学知识。无论你是初学者还是专业人士,Rosalind都能为你提供适合的学习资源和实践机会。你是否想像专业人士一样分析DNA序列?这里有一个简单的任务来帮助你入门。📝。
2024-06-09 18:55:01
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原创 Bio-Info 每日一题:Rosalind-04-Rabbits and Recurrence Relations
🎉 进入生物信息学的世界,与Rosalind一起探索吧!🧬Rosalind是一个在线平台,专为学习和实践生物信息学而设计。该平台提供了一系列循序渐进的编程挑战,帮助用户从基础到高级掌握生物信息学知识。无论你是初学者还是专业人士,Rosalind都能为你提供适合的学习资源和实践机会。你是否想像专业人士一样分析DNA序列?这里有一个简单的任务来帮助你入门。📝。
2024-06-08 23:03:00
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原创 Bio每日一题:Rosalind-03-Complementing a Strand of DNA
在解决生物信息学问题时,使用基础Python代码可以帮助你理解序列操作的基本原理,而借助BioPython等专业库可以大大简化代码,提升效率。根据具体情况选择合适的方法,让你的DNA序列分析更高效、更专业!加入Rosalind,开始你的生物信息学探索之旅吧!纸上得来终觉浅,绝知此事要躬行。
2024-06-07 12:13:27
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原创 Bio每日一题Rosalind-02-Transcribing DNA into RNA
🎉 进入生物信息学的世界,与Rosalind一起探索吧!🧬Rosalind是一个在线平台,专为学习和实践生物信息学而设计。该平台提供了一系列循序渐进的编程挑战,帮助用户从基础到高级掌握生物信息学知识。无论你是初学者还是专业人士,Rosalind都能为你提供适合的学习资源和实践机会
2024-06-06 11:17:39
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原创 生信-VCF小知识
记录个体或群体突变的文件格式,是变异结果存储的标准格式,一般多用于单核苷酸变异或小片段的插入缺失的结果记录。此外也可存储其他变异形式,如CNV、SV等。SNV 是基因组上单个位置的替换。|比如,在参考基因组上记录为 A ,通过检测,某个体由于个体差异或突变,在相同位置变异为C。Indel是指插入或缺失,例如在参考基因组上,某位置为ATCCA,在个体基因组上为ACA(中间位置的TC缺失),则记为A–CA,该位置为deletion。
2024-06-06 11:15:14
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原创 Bio每日一题Rosalind-01-Counting DNA Nucleotides
🎉 进入生物信息学的世界,与Rosalind一起探索吧!🧬Rosalind是一个在线平台,专为学习和实践生物信息学而设计。该平台提供了一系列循序渐进的编程挑战,帮助用户从基础到高级掌握生物信息学知识。无论你是初学者还是专业人士,Rosalind都能为你提供适合的学习资源和实践机会。你是否想像专业人士一样分析DNA序列?这里有一个简单的任务来帮助你入门。我们的第一个挑战:“计数DNA核苷酸” 📊📝给定一个DNA字符串,统计每种核苷酸(A、C、G、T)的出现次数。
2024-06-05 20:31:13
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原创 LLM+PubMed小助手
最近参加一个集训,和团队的小伙伴选择了一个关于搭建生物问答助手的AI题目,由于本人并非人工智能专业,不会训练模型,只知道一些简单的python知识,为了完成任务在网上好一阵找。终于发现了一个宝藏仓库,GPT学术优化!
2024-03-30 18:51:11
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原创 生信基础-wsl+conda+mamba
接触生信也有一段时间了,从一窍不通到现在(二窍不通),中间踩了不少坑。想了想还是写一本简单的入门教程,既能记录自己的学习历程,也能帮助到大家。 之后尽量每天写一小段!!!!!
2023-11-23 18:32:59
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原创 matplotlib绘图‘str‘ object is not callable
最近在学python画图,本来基础掌握就不咋地,又这么长时间不敲代码,啥都记不得了。然而,就在我从头学起的的第二小节就遇上了麻烦。只见我满心欢喜的敲下回车键出来的并不是图,而是一个error。无意间点了一下重启,服了,图出来了。苦苦找寻,不知道自己哪里出错了。脑子一懵,什么,报错了?
2023-10-20 23:13:10
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原创 python爬取酷狗网络红歌榜
从网站网站中获取排名、歌手、歌曲名、时长四个信息。在此通过CSS选择器来获取信息。网站:https://www.kugou.com/yy/rank/home/1-23784.html?from=rank。
2023-10-06 19:39:20
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原创 RNA-seq(一)
RNA-seq(RNA sequencing)是一种基于二代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS)研究转录组学的方法,能够快速获取给定时刻的某一基因组中RNA的种类和数量,从而实现定性与定量分析。随着二代测序技术的发展,RNA-seq的应用场景也不断拓展,在生物学和临床医学等领域都有广泛应用。如今,RNA-seq在诊断、预后和治疗各种疾病(包括癌症和传染病)的应用中具有广阔前景。
2023-07-16 16:57:20
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原创 卸载anaconda后powershell 无法将“D:\anaconda\Scripts\conda.exe”项识别为 cmdlet、函数、脚本文件或可运行程序的名称。
卸载anaconda后powershell 无法将“D:\anaconda\Scripts\conda.exe”项识别为 cmdlet、函数、脚本文件或可运行程序的名称。
2022-12-15 14:46:12
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原创 Endnote引用参考文献将中文文献出现的”et al“设置为“等“的解决方法
Endnote引用参考文献将中文文献出现的”et al“设置为“等“的解决方法
2022-10-26 09:11:19
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