Python | 涡旋识别

写在前面

听别人开题报告，介绍一个涡旋识别的方法，是基于开源的一个python的库。感觉挺有意思的，打算来试试效果

pyEddyTracker

以下是这个库的官网

• https://py-eddy-tracker.readthedocs.io/en/stable/index.html

对于这个库的安装，感觉还是有点小麻烦，虽然官网给的安装方法是可以直接pip install pyEddyTracker

经过测试，在windows上和Linux上都可以成功安装，但是和官网的步骤有点区别，以下是安装步骤：

linux

先安装其中一个依赖库：polygon3

conda install conda-forge::polygon3     

然后进行 pyEddyTracker的安装

pip install pyEddyTracker

windows

• 新建一个虚拟环境

conda create -n py39 python=3.9

conda activate py39

• 进入虚拟环境，先安装相关依赖库
  conda install fastai::opencv-python-headless numpy scipy netCDF4 matplotlib pyyaml pint polygon3

• 安装pyeddytracker
  pip install pyEddyTracker

个例测试

找一个官网的case进行测试,基本的库导入和运行都是可以的

case链接：

• https://py-eddy-tracker.readthedocs.io/en/stable/python_module/02_eddy_identification/pet_filter_and_detection.html#sphx-glr-python-module-02-eddy-identification-pet-filter-and-detection-py

以下是windows的测试情况，可以正常运行：

---

在Linux系统，使用python=3.8的版本，可能不会出现无法得到检查的结果：

# packages in environment at /Users/xpji/miniforge3/envs/p38:
#
# Name                    Version                   Build  Channel
_libgcc_mutex             0.1                 conda_forge    conda-forge
_openmp_mutex             4.5                       2_gnu    conda-forge
asciitree                 0.3.3                    pypi_0    pypi
asttokens                 3.0.0              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
backcall                  0.2.0              pyh9f0ad1d_0    conda-forge
bzip2                     1.0.8                h4bc722e_7    conda-forge
ca-certificates           2025.1.31            hbcca054_0    conda-forge
certifi                   2025.1.31                pypi_0    pypi
cftime                    1.6.4.post1              pypi_0    pypi
charset-normalizer        3.4.1                    pypi_0    pypi
contourpy                 1.1.1                    pypi_0    pypi
cycler                    0.12.1                   pypi_0    pypi
decorator                 5.1.1              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
executing                 2.1.0              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
fasteners                 0.19                     pypi_0    pypi
fonttools                 4.56.0                   pypi_0    pypi
idna                      3.10                     pypi_0    pypi
importlib-resources       6.4.5                    pypi_0    pypi
ipython                   8.12.2             pyh41d4057_0    conda-forge
jedi                      0.19.1             pyhd8ed1ab_0    conda-forge
kiwisolver                1.4.7                    pypi_0    pypi
ld_impl_linux-64          2.43                 h712a8e2_4    conda-forge
libblas                   3.9.0           31_h59b9bed_openblas    conda-forge
libcblas                  3.9.0           31_he106b2a_openblas    conda-forge
libffi                    3.4.6                h2dba641_0    conda-forge
libgcc                    14.2.0               h767d61c_2    conda-forge
libgcc-ng                 14.2.0               h69a702a_2    conda-forge
libgfortran               14.2.0               h69a702a_2    conda-forge
libgfortran5              14.2.0               hf1ad2bd_2    conda-forge
libgomp                   14.2.0               h767d61c_2    conda-forge
liblapack                 3.9.0           31_h7ac8fdf_openblas    conda-forge
liblzma                   5.6.4                hb9d3cd8_0    conda-forge
liblzma-devel             5.6.4                hb9d3cd8_0    conda-forge
libnsl                    2.0.1                hd590300_0    conda-forge
libopenblas               0.3.29          pthreads_h94d23a6_0    conda-forge
libsqlite                 3.49.1               hee588c1_1    conda-forge
libstdcxx                 14.2.0               h8f9b012_2    conda-forge
libstdcxx-ng              14.2.0               h4852527_2    conda-forge
libuuid                   2.38.1               h0b41bf4_0    conda-forge
libxcrypt                 4.4.36               hd590300_1    conda-forge
libzlib                   1.3.1                hb9d3cd8_2    conda-forge
llvmlite                  0.38.1                   pypi_0    pypi
matplotlib                3.7.5                    pypi_0    pypi
matplotlib-inline         0.1.7              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
ncurses                   6.5                  h2d0b736_3    conda-forge
netcdf4                   1.5.8                    pypi_0    pypi
numba                     0.55.2                   pypi_0    pypi
numcodecs                 0.12.1                   pypi_0    pypi
numpy                     1.22.4                   pypi_0    pypi
opencv-python             4.11.0.86                pypi_0    pypi
openssl                   3.4.1                h7b32b05_0    conda-forge
packaging                 24.2                     pypi_0    pypi
parso                     0.8.4              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
pexpect                   4.9.0              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
pickleshare               0.7.5                   py_1003    conda-forge
pillow                    10.4.0                   pypi_0    pypi
pint                      0.18                     pypi_0    pypi
pip                       24.3.1             pyh8b19718_0    conda-forge
polygon3                  3.0.9.1          py38he82f83a_2    conda-forge
prompt-toolkit            3.0.48             pyha770c72_0    conda-forge
prompt_toolkit            3.0.48               hd8ed1ab_1    conda-forge
ptyprocess                0.7.0              pyhd3deb0d_0    conda-forge
pure_eval                 0.2.3              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
pyeddytracker             3.6.1                    pypi_0    pypi
pygments                  2.18.0             pyhd8ed1ab_0    conda-forge
pyparsing                 3.1.4                    pypi_0    pypi
python                    3.8.20          h4a871b0_2_cpython    conda-forge
python-dateutil           2.9.0.post0              pypi_0    pypi
python_abi                3.8                      5_cp38    conda-forge
pyyaml                    6.0.2                    pypi_0    pypi
readline                  8.2                  h8c095d6_2    conda-forge
requests                  2.32.3                   pypi_0    pypi
scipy                     1.10.1                   pypi_0    pypi
setuptools                75.3.0             pyhd8ed1ab_0    conda-forge
six                       1.17.0                   pypi_0    pypi
stack_data                0.6.2              pyhd8ed1ab_0    conda-forge
tk                        8.6.13          noxft_h4845f30_101    conda-forge
traitlets                 5.14.3             pyhd8ed1ab_0    conda-forge
typing_extensions         4.12.2             pyha770c72_0    conda-forge
urllib3                   2.2.3                    pypi_0    pypi
wcwidth                   0.2.13             pyhd8ed1ab_0    conda-forge
wheel                     0.45.1             pyhd8ed1ab_0    conda-forge
xz                        5.6.4                hbcc6ac9_0    conda-forge
xz-gpl-tools              5.6.4                hbcc6ac9_0    conda-forge
xz-tools                  5.6.4                hb9d3cd8_0    conda-forge
zarr                      2.16.1                   pypi_0    pypi
zipp                      3.20.2                   pypi_0    pypi