dicom转nii

使用到python中的dicom2nifti

下载的三种方式：

1. pip install dicom2nifti
2. conda install -c conda-forge dicom2nifti
3. pycharm 中手动安装

为能够正常使用dicom2nifti，需要下载GDCM （不然会报错）
GDCM下载地址（直接下载.exe即可)
GDCM安装指南（注意要将其添加进PATH，即环境变量）

安装过后，执行以下代码

import dicom2nifti

dicom2nifti.convert_directory(dicom_directory, output_folder, compression=True, reorient=True)

发现报错：

dicom2nifti.exceptions.ConversionError: GDCMCONV_NOT_FOUND

主要还是因为没读取到GDCM的路径

解决方法：
win+R 输入cmd调出命令行
输入where gdcmdump查找一下安装位置（path)

import dicom2nifti

dicom2nifti.settings.set_gdcmconv_path(path)
dicom2nifti.convert_directory(dicom_directory, output_folder, compression=True, reorient=True)

即可运行