[samtools] tview查看mapping比对信息

最新推荐文章于 2023-03-12 19:29:32 发布

weixin_34233618

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原文链接：http://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/6568603.html

本文介绍了SAMTools的基本使用方法，包括如何使用samtools view将SAM文件转换为BAM格式，使用samtools sort对BAM文件进行排序，使用samtools index创建BAM文件的索引，最后使用samtools tview进行比对结果的可视化。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

samtools view -bS test.sam > test.bam

samtools sort test.bam -o test_sorted

samtools index -b test_sorted.bam

samtools tview test_sorted.bam ref.fa

转载于:https://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/6568603.html

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