数据库
Mysql
4月4日
心血来潮,折腾Generic Genome Browser Version 2。
PlantGDB
下载了相关fasta文件和对应gff文件。参照http://localhost/gbrowse2/tutorial/tutorial.html
后面附的The MySQL Backend瞎整。
# 注意gff文件要添加类似的一行
# 注意必须是tab,而不可为空格
Chr1 TAIR chromosome 1 30432563 . . . Name=Chr1
注意:phpmyadmin里面的授权“否”是指不能给别人授权。
其他基本上遵从教程即可。
语言
# ubuntu 13.10
# 要显示简体中文
cd /etc/gbrowse/languages
sudo mv zh_cn.pm zh-cn.pm