DSSP Output File

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原文链接：http://www.cnblogs.com/jfxia/archive/2010/04/16/1713882.html

本文详细解释了氨基酸残基的定义与标识方法，包括序列号、PDB链标识、单字母氨基酸代码、二级结构标记等关键信息，帮助读者深入理解蛋白质结构分析的基本概念。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

Columns	Header	Definition
1 - 5	#	Line number
7 - 11	RESIDUE	Residue number, as in PDB file
12		PDB chain
14	AA	Single letter code amino acid, ! for missing residues, X for non-standard
17	STRUCTURE	Secondary structure assignment, see the following legend table
19 - 25	STRUCTURE
	BP1
	BP2
36 - 38	ACC	Accessible surface area
	N-H->O
	O->H-N
	N-H->O
	O->H-N
	TCO
	KAPPA
	ALPHA
104 - 109	PHI	Angle
110 - 115	PSI	Angle
116 - 122	X-CA	C Alpha Coords
123 - 129	Y-CA	C Alpha Coords
130 - 136	Z-CA	C Alpha Coords

Secondary structure markers

Symbol	Definition
G	3 $_{10}$ helix
H	$\alpha$ helix
I	$\pi$ helix
B	$\beta$ bridge
E	$\beta$ sheet
T	turn
S	high curvature region
	other (loop)

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使用Python进行批量处理：从PDB文件生成DSSP文件

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358

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