离线安装/使用dssp

# 背景
1.目的：在学校超算平台上预测了大量的PDB文件。现需python的Bio库调用dssp，批量计算并统计这些结构的dssp。
2.问题：超算平台无法联网，无法通过conda Install安装dssp。之前使用AF2时，将工作站上的环境打包移植到了超算平台上，但dssp相关文件缺失（可能因为dssp不属于python的库，python只是调用该软件，所以无法跟随环境被一起移植？）

#解决过程
1.失败方案：参考该篇博客科学网—biopython中的dssp在 linux 中的安装使用 - 陈照强的博文 (sciencenet.cn)，下载了dssp文件夹/mkdssp文件，修改权限和环境变量后，也尝试了文中所提的直接指定路径，依然报错“permission denied”拒绝访问。猜想文件损坏原因/配置不匹配等导致。
2.成功方案：
（1）在自己工作站上创建一个新的虚拟环境（防止和工作站上的原有环境和包冲突/影响），环境命名dssp，python版本指定为3.9（根据自身情况定）
【conda create -n dssp python=3.9】
提醒：每次创建或使用新环境前，记得退出原有环境
【conda deactivate】
判断是否处于某环境中，可通过看终端指令前是否有（），如（base）XXX@Tiger3:~$，则说明在base环境中，也建议先退出，否则容易造成环境层数的叠加，导致后续指令的错误。
（2）激活环境
【source activate dssp】
（3）下载dssp（主要用于得到mkdssp文件）
【conda install -c ostrokach dssp】，出现提示默认yes（输入y）就行
（4）搜索dssp文件所在的文件夹
【 which mkdssp】
（5）到指示的文件夹内，将mkdssp文件下载下来，传输到超算平台的对应文件夹（主要为报错信息指示的找不到文件/文件权限被拒绝的位置，如我的为/gs/home/anaconda3/envs/HPC/lib/python3.9/site-packages/Bio/PDB/）
（6）修改mkdssp文件权限为可访问使用
（7）将mkdssp所在文件夹的地址，添加到环境变量中
【export PATH=$PATH:/gs/home/anaconda3/envs/HPC/lib/python3.9/site-packages/Bio/PDB/】
（8）在运行脚本中的dssp指令行中，添加指定地址
【dssp=DSSP(model_rec,pdbfile,dssp="/home/anaconda3/envs/HPC/lib/python3.9/site-packages/Bio/PDB/mkdssp")】
（9）可运行