什么是SSLP和ISSR？

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本文介绍了SSLP（简单序列长度多态性）和ISSR（简单序列重复扩增反应）的概念，以及如何通过微卫星序列的侧翼序列设计引物进行PCR扩增，产生长度多态性。讨论了微卫星标记在基因组中的分布、等位性变异、检测手段及应用限制。

什么是SSLP和ISSR？
简单序列长度多态性（simple sequence length polymorphism，SSLP）是据串联重复排列微卫星基序两侧的单一序列设计引物，对微卫星序列（microsatellite DNA或simple sequence repeats，SSR）进行扩增，由微卫星基序重复数目的变异而产生多态性。由于基因组中某一特定的微卫星的侧翼序列通常都是保守性较强的单一序列，因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序，然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增，从而将单个微卫星位点扩增出来。由于单个微卫星位点重复单元在数量上的变异，个体的扩增产物在长度上的变化就产生长度的多态性，这一多态性称为SSLP，每一扩增位点就代表了这一位点的一对等位基因。 SSLP是一些长度不等的重复序列、有多个等位基因位点，它们多为2-4个核苷酸序列重复（也叫微卫星标记），在不同动植物品系中其重复次数不同，故可用 PCR法来检测各该多态性序列的长度，从而快速测定出多种回交后代中标记物的分离方式。
由于微卫星标记在基因组中广泛分布，等位性变异丰富，检测手段简便，稳定可靠而受重视，但是微卫星标记要求已知微卫星两侧单一序列信息而使其发展受到限制，同时微卫星标记具有严格的种属特异性也使其应用上受到限制。

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