使用Cytoscape画PPI网络图

最新推荐文章于 2025-03-25 17:31:20 发布
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文章标签： python
原文链接：http://www.cnblogs.com/yahengwang/p/10652348.html
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本文介绍了如何使用Cytoscape软件导入string_interactions.tsv文件并进行网络图分析。通过详细步骤展示了从文件导入到使用NetworkAnalyzer进行网络图分析的过程。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

打开Cytoscape软件，根据菜单导入string_interactions.tsv文件

File ----> Import ----> Network from File

会弹出下图对话框，在对话框中设置如下：

选中string_interactions.tsv文件，点击打开，导入文件，结果如下图所示。

点击OK，弹出如下视图，ctrl+A选中所有基因节点

使用NetworkAnalyzer分析调整网络图

Tools ---> NetworkAnalyzer ---> Network Analysis ---> Analyze Network

弹出如下跳选框

选择Treat the network as undirected，点击ok

最终生成下图网络

 

转载于:https://www.cnblogs.com/yahengwang/p/10652348.html

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