PICRUSt2是一款用于预测微生物群落功能丰度的软件，基于标记基因序列，如16S rRNA。本文介绍了如何安装、准备数据以及使用PICRUSt2，并详细列出各种预测结果文件的含义，包括KO和EC功能的丰度预测，以及OTU对功能的贡献等。
PICRUSt2
PICRUSt2(Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States)是一款基于标记基因序列来预测功能丰度的软件。“功能”通常指的是基因家族，如KEGG同源基因和酶分类号，但可以预测任何一个任意的特性。同样，预测通常基于16S rRNA基因测序数据，但也可以使用其他标记基因.
PICRUSt2相关使用方法来啦!!!
一、安装
#使用 bioconda 安装 PICRUSt2 环境
conda create -n picrust2 -c bioconda -c conda-forge picrust2
#激活环境
source activate picrust2
#退出环境
source deactivate picrust2
二、准备数据
PICRUSt2无需再以GreenGene注释的OTU表为输入，可以直接读取OTU的代表序列自动完成物种注释，并进一步根据物种丰度组成预测群落功能。文件otu_table.txt为OTU丰度表格，仅包含丰度组成信息即可，无需添加注释列。文件otu.fasta中包含了OTU丰度表中各OTU的代表序列。
三、使用
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