NCBI|叶绿体基因组数据上传

最新推荐文章于 2024-10-31 14:39:59 发布
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本文详细介绍了如何在NCBI上上传叶绿体基因组数据，包括登录、填写联系人信息、参考文献、测序技术、核苷酸信息、投稿类别、源修饰器、特征和审核步骤，提供了关键注意事项和转换文件的方法。

叶绿体基因组NCBI上传

小编最近在NCBI上传了好几次数据…想着可以把具体的上传步骤写下来，供大家参考。以下是叶绿体基因组的上传示例，大家可以瞅瞅 图片

准备工作

1.登录NCBI官网：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/， 依次点击“sign in to NCBI”——“See more 3rd party sign in options”——搜索“Microsoft live.com”。

”sign in to NCBI“
在这里插入图片描述

”See more 3rd party sign in options“
图片

选择你登录的方式，小编使用的是“Microsoft live.com”
在这里插入图片描述
2. 登录账户：输入邮箱账号，点击“下一步”，稍后输入密码。
在这里插入图片描述
3.点击上传数据：

点击“submit”

点击“GenBank”目录下中间的“

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e15-4yp-Optimizing-chloroplast-genome-assembly-and-annotation-with-skim-sequencing-data:叶绿体基因和基因组是用于植物系统发育和物种鉴定的最重要的基因组数据。 脱脂测序正在获得低覆盖率的基因组测序数据，包括核，叶绿体和线粒体基因组序列。 由于高通量测序技术的飞速发展，获取整个基因组的低覆盖率数据（通常约为20-30GB数据）便宜，足以组装完整的叶绿体基因组。 迄今为止，描述了许多组装过程以组装完整的叶绿体基因组。 但是，
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往NCBI上上传数据： 1.注册并登陆NCBI，点击主页的submit选项 2.创建bioproject，以及biosample号 （Bioproject: Bioproject是一个项目的编号，在文章发表的时候，读者需要通过这个号来找到你文章中的数据存放到哪里去了，因此，在投稿之前，我们需要上传数据并拿到这个ID号。这个id号下面可以存放很多个不同的reads、序列等等，例如在我的项目里面，...
最新 NCBI 上传测序数据教程 （图文详解）
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1、登录或注册用户 网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/ 2、进入SRA 网址：https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/ 向下滚动，找到Sequence Read Archive (SRA)工具，点击Submit 2、新建提交 3、按要求填写信息 4、使用ascp ascp -i /mnt/h/work/aspera.openssh -QT -l100m -k1 -d /mnt/h/work/ncbi_upload/raw/ sub
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NCBI 数据上传指南：科研人员的必备宝典 【下载地址】NCBI数据上传指南分享 本仓库提供了一个名为“NCBI 数据上传指南.pdf”的资源文件下载。该文件详细介绍了如何在NCBI（美国国家生物技术信息中心）上传数据的具体步骤和注意事项。无论您是科研人员、生物信息学专家还是数据管理人员，这份指南都将为您提供宝贵的参考信...
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NCBI的重要性不用说明，你知道的，它很重要。在发表文章时，一般都会要求公开文章中使用的数据。例如，将测序数据上传到NCBI的GEO或者SRA服务器中，然后在文章中使用数据库提供的编号，方便其他人检索和使用。下面，我们简单介绍一下NCBI测序数据的上传流程。注意：请确保读完整个文档再开始上传数据，切记！！
叶绿体基因组圈图
courage4132231的博客
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1.CPGAVAS http://47.96.249.172:16019/analyzer/annotate 打不开了 2.OGdraw：http://ogdraw.mpimp-golm.mpg.de/index.shtml（一般文章常用圈图网站，但最近已崩） 3.GenomeVx：http://wolfe.ucd.ie/GenomeVx/(输入.gb格式） ![SWLD63_~]24_OP0T8...
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