ERα 作为配体依赖性转录因子,通过激活下游靶基因如 Cyclin D1 调控细胞周期进程。其蛋白稳定性受泛素化修饰严格调控,而泛素特异性蛋白酶 22(USP22)通过去泛素化作用维持 ERα 的蛋白丰度。然而,USP22-ERα 轴的转录后调控机制仍不明确。
N6 - 甲基腺苷(m6A)修饰作为真核生物中最普遍的 RNA 修饰方式,通过 "写"(如 METTL3/METTL14)、"擦"(如 FTO)、"读"(如 YTHDC1/YTHDF1)蛋白动态调控 RNA 代谢。近年来研究表明,m6A 修饰在肿瘤发生发展中发挥关键作用,但其在 ERα+ 乳腺癌中的具体机制尚未完全阐明。
一、研究方法
(一)细胞模型与试剂
人乳腺癌细胞系(MCF-7、T47D 等)及正常乳腺上皮细胞 MCF10A ,使用含 10% 胎牛血清的培养基培养。Actinomycin D(M4881,AbMole),MG132(蛋白酶体抑制剂)用于 mRNA 稳定性实验。
(二)siRNA 筛选与稳转细胞系构建
采用包含 m6A 相关基因的 siRNA 文库转染 MCF-7 细胞,通过 Western blot 筛选影响 USP22 表达的关键基因。构建 METTL14 shRNA 慢病毒载体,感染 MCF-7 和 T47D 细胞,经嘌呤霉素筛选获得稳定敲低细胞系。
(三)分子生物学实验
- RNA 结合蛋白免疫沉淀(RIP):使用 Magna RIP Kit,以抗 METTL14、METTL3 或 IgG 抗体捕获 RNA - 蛋白复合物,通过 qPCR 检测 USP22 和 ERα mRNA 的富集量。
- 甲基化 RNA 免疫沉淀(MeRIP):采用 Magna MeRIP Kit,使用抗 m6A 抗体富集甲基化 RNA,qPCR 检测 USP22 和 ERα mRNA 的 m6A 修饰水平。
- mRNA 稳定性分析:细胞经 Actinomycin D(M4881,AbMole)处理后,在不同时间点提取 RNA,RT-qPCR 检测 mRNA 半衰期。
(四)功能实验
- 细胞增殖检测:CCK-8 法(AbMole)检测细胞活力,EdU 染色(AbMole)评估 DNA 合成,克隆形成实验分析长期增殖能力。
- 迁移实验:Transwell 小室和划痕愈合实验检测细胞迁移能力。
(五)动物实验
NOD/SCID 小鼠(雌性,4-6 周)皮下注射稳定敲低 METTL14 的 MCF-7 细胞,植入雌激素缓释 pellets 模拟体内激素环境。通过 IVIS 成像系统监测肿瘤生长,免疫组化检测 Ki67 和 ERα 表达。
二、实验过程
(一)siRNA 文库筛选
将 MCF-7 细胞接种于 96 孔板,转染 siRNA 文库(每孔 10 nM),48 小时后裂解细胞,Western blot 检测 USP22 蛋白水平。发现敲低 METTL14 和 METTL3 显著降低 USP22 表达,进一步验证确认 METTL14 为关键调控因子。
(二)mRNA 稳定性实验
MCF-7 和 T47D 细胞分别转染 si-NC 或 si-METTL14,48 小时后加入 Actinomycin D(M4881,AbMole,5 μg/mL)处理,于 0、2、4、6 小时收集 RNA。RT-qPCR 结果显示,METTL14 敲低组 USP22 和 ERα mRNA 半衰期显著缩短。
(三)RIP-qPCR 验证
裂解 MCF-7 细胞,制备细胞裂解液,与抗 METTL14 抗体孵育过夜。磁珠捕获复合物后,提取 RNA 进行 qPCR。结果显示,METTL14 与 USP22 和 ERα mRNA 直接结合,敲低 METTL14 显著降低结合效率。
(四)MeRIP-qPCR 分析
提取 T47D 细胞总 RNA,超声破碎后与抗 m6A 抗体孵育。富集的甲基化 RNA 经纯化后进行 qPCR,发现 METTL14 敲低组 USP22 和 ERα mRNA 的 m6A 修饰水平显著下降。
(五)体内成瘤实验
将稳定敲低 METTL14 的 MCF-7 细胞(2×10^6)注射至小鼠右侧腋窝,同时植入雌激素 pellets。每周测量肿瘤体积,28 天后处死小鼠。结果显示,METTL14 敲低组肿瘤体积和重量显著小于对照组,免疫组化显示 Ki67 阳性细胞减少。
三、实验结果分析
(一)METTL14 调控 USP22 和 ERα 的表达
- 基因表达水平:Western blot 和 RT-qPCR 结果显示,敲低 METTL14 显著降低 USP22 和 ERα 的蛋白及 mRNA 水平,过表达 METTL14 则显著上调其表达。
- 临床相关性:UALCAN 和 GEPIA 数据库分析显示,METTL14 在乳腺癌组织中高表达,且与 USP22 和 ERα 表达呈正相关。
(二)m6A 修饰的机制验证
- 结合能力:RIP 实验证实 METTL14 与 USP22 和 ERα mRNA 直接结合,敲低 METTL14 显著降低结合效率。
- 甲基化水平:MeRIP 实验显示,METTL14 敲低导致 USP22 和 ERα mRNA 的 m6A 修饰水平下降,过表达野生型 METTL14(而非催化失活突变体 R298P)可恢复甲基化水平。
- 稳定性调控:Actinomycin D(M4881,AbMole)处理实验表明,METTL14 通过 m6A 修饰延长 USP22 和 ERα mRNA 的半衰期。
(三)功能影响的验证
- 细胞增殖:CCK-8 和 EdU 实验显示,敲低 METTL14 显著抑制 MCF-7 和 T47D 细胞的增殖能力,过表达 METTL14 则促进增殖。
- 迁移能力:Transwell 和划痕实验结果一致表明,METTL14 敲低组细胞迁移能力显著下降。
- 体内实验:动物实验证实,敲低 METTL14 抑制肿瘤生长,且 ERα 和 Ki67 表达降低。
(四)信号通路分析
- ERα 稳定性:Co-IP 实验显示,敲低 METTL14 增加 ERα 的泛素化水平,过表达 USP22 可部分逆转这一效应。
- 下游靶基因:敲低 METTL14 导致 Cyclin D1 表达下降,过表达 ERα 可恢复 Cyclin D1 水平及细胞增殖能力。
四、讨论与展望
本研究首次揭示了 METTL14 通过 m6A 修饰增强 USP22-ERα 轴促进乳腺癌恶性进展的机制。METTL14 作为 m6A"写手",通过直接结合 USP22 和 ERα mRNA,增加其 m6A 修饰水平,进而延长 mRNA 半衰期,维持蛋白稳定性。YTHDC1 和 YTHDF1 分别作为 "读者" 蛋白,识别修饰后的 mRNA,进一步调控其功能。
研究结果为 ERα+ 乳腺癌的研究提供了新的潜在靶点。未来需进一步探索 METTL14 抑制剂的开发的可能性。