Python脚本提取氨基酸序列的阿贝尔复杂度

最新推荐文章于 2025-04-29 21:37:16 发布

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本文介绍如何使用Python脚本分析氨基酸序列的阿贝尔复杂度，以序列'INPVQQQN'为实例，探讨其计算过程。

def get_set_number(a):  #get Abe_cpx combination not the rank 
    a_2  = []
    for i in range(len(a)):
        a[i] = sorted(a[i])
        a[i] = ''.join(a[i])
        a_2.append(a[i])
    a_2_set = set(a_2)
    a_2_set_length = len(a_2_set)
    return a_2_set_length

def abe_cpx(w):
        empty_list = []
        for j in range(len(w)+1):
                for i in range(len(w)-j+1):
                        empty_list.append(w[i:i+j])
        empty_list = list(filter(None,empty_list))  #filter "" of all examples
        #print(empty_list)
        empty_list_set = set(empty_list)
        empty_list_set = sorted(empty_list_set,key = lambda i:len(i),reverse=False)
        #print(empty_list_set)
        list_num = []
        for i in range(1,len(w)+1):
                list_1 =[]
                for j in range(len(empty_list_set)):
                        if len(empty_list_set[j]) == i:
                                list_1.append(empty_list