22、生物Perl中构建精美代码的Bio::Graphics库详解

rust6ferris

于 2025-07-11 11:25:40 发布

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分类专栏：《美丽代码》：编程艺术的探索与实践文章标签： Bio::Graphics 生物Perl 基因组可视化

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生物Perl中构建精美代码的Bio::Graphics库详解

1. Bio::Graphics基础示例

Bio::Graphics是一个强大的工具，可用于可视化生物序列特征。下面是一个简单的示例代码，展示了如何使用Bio::Graphics：

#!/usr/bin/perl
use strict;
use Bio::Graphics;
use Bio::SeqFeature::Generic;
my $bsg = 'Bio::SeqFeature::Generic';
my $span         = $bsg->new(-start=>1,-end=>1000);
my $test1_feat   = $bsg->new(-start=>300,-end=>700,
                             -display_name=>'Test Feature',
                             -source_tag=>'This is only a test');
my $test2_feat = $bsg->new(-start=>650,-end=>800,
                           -display_name=>'Test Feature 2');
my $panel        = Bio::Graphics::Panel->new(-width=>600,-length=>$span->length,