生信&数据挖掘——人工神经网络篇(1)软件准备

已于 2023-01-20 16:35:00 修改
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分类专栏： 生物信息学 文章标签： 数据挖掘 人工智能
于 2023-01-20 16:29:43 首次发布
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版权
本文介绍了人工神经网络在复杂问题解决中的应用，如图像识别和数据挖掘。接着详细阐述了使用R语言和Rstudio进行GEO数据下载、注释、批次矫正、差异分析等生物信息学流程，并涉及神经网络模型构建、ROC曲线评估以及免疫细胞浸润和差异分析。这些方法和工具在数据科学和生物信息学领域具有重要价值。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

目录

序言：

主要内容

软件准备

R语言下载

R语言安装

 Rstudio下载安装

Rstudio界面解释

序言：

人工神经网络（ANN），这是一种基于模拟生物神经网络的计算机模型，它可以用来解决复杂的问题，如识别图像、语音识别、自然语言处理等。 ANN可以模拟人类大脑的学习和记忆过程，它可以从大量的数据中学习，并从中提取出有用的信息。它可以自动识别模式，并从中提取出有用的信息，从而提高数据挖掘的效率。 ANN的应用非常广泛，它可以用来解决复杂的问题，如自动驾驶、机器人控制、智能家居等。它还可以用来改善现有的数据挖掘算法，从而提高数据挖掘的效率。 博主我相信，ANN将会成为未来数据挖掘的重要工具，它将为我们提供更多的机会，让我们可以更好地利用数据，更好地服务于社会。

主要内容

➢ 简介
➢ GEO 数据下载
➢ GEO 数据注释
➢ 数据批次矫正
➢ 差异分析
➢ GO 和 KEGG 富集分析
➢ 蛋白互作网络
➢ 随机森林树
➢ 神经网络模型
➢ ROC 曲线
➢ 免疫细胞浸润
➢ 免疫细胞差异分析

软件准备

R语言下载

下载地址为：https://cran.r-project.org

按照下面步骤

1.点击base

2.点击Download R 3.5.1 for Windows (62 megabytes,32/64 bit)

 

R语言安装

  双击开始安装，跟一般的软件安装一样，根据需要进行相关安装设置并不断点击下一步即可。

 Rstudio下载安装

下载地址： http://www.rstudio.com/ide

单击蓝色圆形图标，进入跳转到Desktop版本下载窗口，Desktop版本又分为两个版本：Open Source Edition（免费）和Commercial License（付费）。

自己用的话可选择前者，单击【DOWNLOAD RSRUDIO DESKTOP】。
双击【RStudio-0.99.903.exe】进行安装

Rstudio界面解释

 perl安装同理

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