
报错记录
记录在各个场景遇到的报错及解决方式
山复尔尔28
菜鸟选手,爱吃妙脆角
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解决python matplotlib画图无法显示中文的问题
在用matplotlib做一个简单的可视化统计时,由于标签是中文,无法显示,只是显示出来一些方框(如图)去对应的网站下载字体的tiff文件再导入到字体库中,再设置plt使用的字体为”SimHei“即可。问题在于,当前matplotlib使用的字体不支持中文,我们进行替换就可以了。结果为False,说明需要下载需要的字体再导入到字体库中。我想替换为黑体,找到对应的英文名为“SimHei”检查一下”SimHei“是否已经在字体库中。原创 2024-11-03 15:22:52 · 440 阅读 · 0 评论 -
解决return code from pthread_create() is 22报错问题
可能时rma函数会涉及调用多线程的操作,这一过程会产生冲突。此错误表示在规范化过程中创建新线程时出现问题,特别是与。虽然这可能会在多核环境中略微降低性能,但它确保了稳定性并避免了导致错误的线程问题。今天在处理芯片数据,在使用rma方法对数据进行预处理时报错,试了非常多的方法,记录一下。禁用线程将强制包以单线程模式运行,这可以避免。重启之后,再次运行rma函数,发现报错消失,问题成功解决!为了解决这个问题,我们可以在负责。最后一步,需要重启R(需要耐心等待一会儿)原创 2024-11-06 19:02:47 · 998 阅读 · 0 评论 -
[E::bwa_idx_load_from_disk] fail to locate the index file
在进行fq文件与参考基因组进行比对时,明明我已经通过 bwa index建好了参考基因组的五个索引文件,但是运行bwa mem时,老是显示找不到index文件fail to locate the index file。“无论如何,索引文件名都是从FASTA引用文件派生的。因此,您需要在后续命令中调整索引文件名”也就是说。如上图,我将它们放在一个文件夹中,前缀都改成了和原fa文件一致的前缀名,在进行bwa比对时候,最终在一篇外网的解答中找到了答案。运行成功,开始比对!原创 2024-04-20 12:06:02 · 1537 阅读 · 0 评论 -
error: Error in getopt(spec = spec, opt = args) : long flag “args“ is invalid
这个错误来自R语言中的getopt函数。报错信息表明在调用getopt函数时,提供了一个无效的长参数标志(long flag)"args"。这通常意味着在函数调用时,长参数的格式可能有误,比如没有以两个连字符(--)开头,或者参数名不正确。但我反复检查了自己的命令,没有任何问题,格式也正确,GATK版本4.5,R版本4.3,我降低了GATK的版本,没有用,依然报错,,但是为什么我不太清楚,猜测可能是版本不兼容吧,因为R是需要从GATK传递的参数进行绘图操作。在跑GATK流程分析CNV时,遇到了这样的错误。原创 2024-04-30 21:28:53 · 460 阅读 · 0 评论 -
sym函数创建字符变量的报错问题
Matlab中创建字符变量时出现报错问题原创 2023-07-01 15:36:44 · 3527 阅读 · 0 评论