Linux下载STRUCTURE

做GWAS求Q矩阵，有很多软件可选，STRUCTURE、ADMIXTURE、PLINK、TASSEL、EIGENSOFT等，先用STRUCTURE试试看。

其实昨天下载解压完一直报错说没有structure文件或者目录，查了很多都查不到原因。就先用Admixture软件跑了一下，今天再想着看看能不能解决报错，没想到成功了。

STRUCTURE软件

功能: STRUCTURE 是一个经典的群体遗传学软件，用于分析群体结构和个体的混合比例。

特点: 它基于贝叶斯模型聚类方法，估计个体的群体归属概率，从而构建 Q 矩阵。

适用范围: 适合于具有离散群体的分析，但计算量较大，尤其是对于大数据集。

官网：Structure Software: V. 2.3.4

1.下载

wget https://web.stanford.edu/group/pritchardlab/structure_software/release_versions/v2.3.4/release/structure_linux_console.tar.gz

2.解压

tar zxvf structure