在linux上安装r-base和rpy2到conda环境

白金之星1717

已于 2024-10-23 19:43:49 修改

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文章标签： python

于 2024-10-23 19:42:33 首次发布

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安装r-base(国外，可能需要很久>5min，或者需要多次尝试)

conda install r-base

安装rpy2

pip install rpy2

在r-base下安装R包

在命令行输入R进入R语言环境，安装其他R包

install.packages("mclust")

安装完成后退出R环境：

q()

可能的报错

1.安装R包失败--安装“xxx”时退出状态的值不是0

解决方案：安装更新版本的r-base

2.r-base，rpy2，numpy版本直接的不兼容可能导致额外的错误

可用的版本搭配如下

# Name                    Version            
r-base                    4.1.0              
rpy2                      3.5.0              
scanpy                    1.10.3             
torch                     2.4.0     
numpy                     1.24.4