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原创 隐马尔可夫模型的简单理解的例子

以上例子摘自《HMM及其在生物信息学中的应用》蒋红敬，非常通俗易懂的一个理解隐马尔可夫模型概念的举例。

2024-06-26 09:25:42 224

原创 Linux如何重命名和操作开头是横杠-的目录

不小心创建了开头是横杠的目录比如-P。如果想进入-P的目录，命令是。再删除名字为1的目录。

2024-05-10 09:26:15 344

原创 conda环境管理

conda查看现有环境。conda创建新环境。

2024-05-07 11:11:53 139

原创 conda安装最新版的salmon出现冲突报错

conda安装软件冲突的解决方法

2024-01-17 10:46:56 937

原创 perl判断文件是否存在

设置一个变量用来保存判断文件是否存在的结果，比如$test。变量$file 是文件名（包含路径）

2023-08-22 09:53:10 383

原创 awk如何匹配正则表达式

第3列是否含有97，awk里的正则表达用~/要匹配的内容/

2023-08-22 09:45:19 405

原创 awk 按列求和

比如awk按第一列求和。

2023-08-22 09:41:14 354

原创 如何解压tar.bz2

【代码】如何解压tar.bz2。

2023-08-22 09:38:55 664 1

原创 wget下载并重命名

newfilename 是下载后重命名的名字。

2023-08-18 15:16:48 2093 1

原创 sort 按数字大小排序

linux中直接使用sort不是按数字大小排序。按数字大小排序需要加上 -n。

2023-08-18 09:26:44 309 1

原创 x的m次幂的m-1阶差分

这是《数学小丛书》差分多项式一章中留给读者的思考题，在网上搜集没有理想的结果，最后还是在这篇微信推送的参考文献中找到了理想的证明过程，林庆泽.高阶等差级数的一些理论及其应用[J].兰州文理学院学报(自然科学版),2015,29(05):26-29。（r-可重排列： 集合 A(元素个数＝n)中可重复地选 r 个(r

2023-08-17 13:57:05 213 1

原创 shell 循环输出数

【代码】shell 循环输出数。

2023-08-17 09:35:10 183 1

原创 json在线解析

推荐一个线上的看json结构的网站。

2023-08-15 10:53:07 284

原创 按id提取fasta文件

在txt文件中写需要的id，用seqtk进行提取。

2023-08-15 10:08:41 285

原创 R语言清除全部变量

rm(list = ls())

2023-07-27 09:23:02 385 2

转载 XShell提示“无法访问用户数据文件夹”

Xshell问题解决

2023-01-29 09:45:32 1558

原创 awk如何输出指定字符串

awk输出指定字符串

2022-09-08 10:16:25 1569 2

原创 trimmomatic参数理解

trimmomatic的参数理解

2022-08-25 15:24:55 3041

原创 如何安装perl模块

如何安装perl模块

2022-08-09 14:18:41 3710

原创 给参考基因组建立index

给参考基因组建立index

2022-06-17 17:00:22 898

原创 linux不解压看zip包内容

linux不解压看zip包内容

2022-06-17 16:48:59 1574

原创 如何理解monophyly单系性

如何理解monophyly单系性

2022-06-17 11:27:04 1167

原创 R语言从文件读入数据

R语言从文件读入数据

2022-06-15 14:52:15 985

原创 metawrap quant_bins 的bin_abundance_table.tab结果理解

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2022-06-15 14:41:22 662

原创 perl如何遍历hash

perl如何遍历hash

2022-06-15 09:44:39 2005

原创 salmon的报错解决error while loading shared libraries: libboost_iostreams.so.1.60.0

salmon的报错解决error while loading shared libraries: libboost_iostreams.so.1.60.0

2022-06-15 09:35:49 2242

原创 conda如何安装R包

conda如何安装R包

2022-06-15 09:31:04 4937

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