GraphRAG - 使用 LLM 生成知识图谱

生成式AI进入知识图谱时代?微软开源的GraphRAG爆火,Github Star量破万 这里,这两个答案都是准确的。近日,Neo4j 公司 CTO Philip Rathle 发布了一篇标题为《GraphRAG 宣言:将知识加入到生成式 AI 中》的博客文章,Rathle 用通俗易懂的语言详细介绍了 GraphRAG 的原理、与传统 RAG 的区别、GraphRAG 的优势等。现如今,RAG 是一种使用真实世界信息改进 LLM 输出的技术,是大多数基于 LLM 的工具的重要组成部分,一般而言,RAG 使用向量相似性作为搜索,称之为 Baseline RAG(基准RAG)。 阅读详情

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GraphRAG是微软开源的一个项目,它利用图(Graph)来增强检索(Retrieval)和生成(Generation)的能力,通过结合知识图谱与图机器学习,提升大型语言模型在私有数据集上的推理和问答性能。

graphrag-architecture-diagram.png

主要功能

GraphRAG的主要功能包括:

  • 知识图谱构建:利用大型语言模型(LLM)从非结构化文本中提取实体、关系和关键声明,构建知识图谱。
  • 增强检索能力:通过知识图谱的语义理解,增强模型对复杂查询的检索能力,提供与问题真正匹配的答案。
  • 综合推理与生成:能够跨越分散的信息片段,通过共享属性将它们串联起来,提供合成的新见解,并生成自然流畅的回答。
  • 主题总结与概括:能够整体理解并总结大型数据集合或单一长篇文档的语义概念,回答如“数据集中的主要主题是什么?”等全局性问题。

安装部署

建议尝试使用解决方案加速器包。这为 Azure 资源提供了用户友好的端到端体验。

开源编译

环境准备
NameInstallationPurpose
Python 3.10 or 3.11DownloadThe library is Python-based.
PoetryInstructionsPoetry is used for package management and virtualenv management in Python codebases

Getting Started

Install Dependencies
# Install Python dependencies.
poetry install
Execute the Indexing Engine
poetry run poe index <...args>
Executing Queries
poetry run poe query <...args>

Azurite

Some unit and smoke tests use Azurite to emulate Azure resources. This can be started by running:

./scripts/start-azurite.sh

or by simply running azurite in the terminal if already installed globally. See the Azurite documentation for more information about how to install and use Azurite.

Lifecycle Scripts

Our Python package utilizes Poetry to manage dependencies and poethepoet to manage build scripts.

Available scripts are:

  • poetry run poe index - Run the Indexing CLI
  • poetry run poe query - Run the Query CLI
  • poetry build - This invokes poetry build, which will build a wheel file and other distributable artifacts.
  • poetry run poe test - This will execute all tests.
  • poetry run poe test_unit - This will execute unit tests.
  • poetry run poe test_integration - This will execute integration tests.
  • poetry run poe test_smoke - This will execute smoke tests.
  • poetry run poe check - This will perform a suite of static checks across the package, including:
    • formatting
    • documentation formatting
    • linting
    • security patterns
    • type-checking
  • poetry run poe fix - This will apply any available auto-fixes to the package. Usually this is just formatting fixes.
  • poetry run poe fix_unsafe - This will apply any available auto-fixes to the package, including those that may be unsafe.
  • poetry run poe format - Explicitly run the formatter across the package.
Troubleshooting
“RuntimeError: llvm-config failed executing, please point LLVM_CONFIG to the path for llvm-config” when running poetry install

Make sure llvm-9 and llvm-9-dev are installed:

sudo apt-get install llvm-9 llvm-9-dev

and then in your bashrc, add

export LLVM_CONFIG=/usr/bin/llvm-config-9

“numba/_pymodule.h:6:10: fatal error: Python.h: No such file or directory” when running poetry install

Make sure you have python3.10-dev installed or more generally python<version>-dev

sudo apt-get install python3.10-dev

LLM call constantly exceeds TPM, RPM or time limits

GRAPHRAG_LLM_THREAD_COUNT and GRAPHRAG_EMBEDDING_THREAD_COUNT are both set to 50 by default. You can modify this values to reduce concurrency. Please refer to the Configuration Documents

基于llm+rag构建自己的知识图谱 点击进去会有一个注册框,填写完成自己的信息之后会进入下载页面。同时需要注意保留页面左下角的激活码。按照下载页面的安装说明进行安装。这些数据库在存储和查询知识图谱数据时具有不同的特点和优势,选择适合自己需求的数据库取决于具体的应用场景和性能需求。至于llm和rag技术这里不做过多赘述,可以查看前面的学习笔记,下面主要介绍一下知识图谱,,密码在首次登录时设置。接下来就像mysql数据那样,可以直接通过Neo4j浏览器进行操作。在浏览器中打开Neo4j Web界面,并登录。而三元组是图中的基本数据单元。 阅读详情

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B. Palm", title = "Prediction as a candidate for learning deep hierarchical models of data", year = "2012",}```Contact: rasmusbergpalm at gmail dot comDirectories included in the toolbox-----------------------------------`NN/` - A library for Feedforward Backpropagation Neural Networks`CNN/` - A library for Convolutional Neural Networks`DBN/` - A library for Deep Belief Networks`SAE/` - A library for Stacked Auto-Encoders`CAE/` - A library for Convolutional Auto-Encoders`util/` - Utility functions used by the libraries`data/` - Data used by the examples`tests/` - unit tests to verify toolbox is workingFor references on each library check REFS.mdSetup-----1. Download.2. addpath(genpath('DeepLearnToolbox'));Example: Deep Belief Network---------------------```matlabfunction test_example_DBNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit RBM and visualize its weightsrand('state',0)dbn.sizes = [100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);figure; visualize(dbn.rbm{1}.W'); % Visualize the RBM weights%% ex2 train a 100-100 hidden unit DBN and use its weights to initialize a NNrand('state',0)%train dbndbn.sizes = [100 100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);%unfold dbn to nnnn = dbnunfoldtonn(dbn, 10);nn.activation_function = 'sigm';%train nnopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.10, 'Too big error');```Example: Stacked Auto-Encoders---------------------```matlabfunction test_example_SAEload mnist_uint8;train_x = double(train_x)/255;test_x = double(test_x)/255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit SDAE and use it to initialize a FFNN% Setup and train a stacked denoising autoencoder (SDAE)rand('state',0)sae = saesetup([784 100]);sae.ae{1}.activation_function = 'sigm';sae.ae{1}.learningRate = 1;sae.ae{1}.inputZeroMaskedFraction = 0.5;opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;sae = saetrain(sae, train_x, opts);visualize(sae.ae{1}.W{1}(:,2:end)')% Use the SDAE to initialize a FFNNnn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm';nn.learningRate = 1;nn.W{1} = sae.ae{1}.W{1};% Train the FFNNopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.16, 'Too big error');```Example: Convolutional Neural Nets---------------------```matlabfunction test_example_CNNload mnist_uint8;train_x = double(reshape(train_x',28,28,60000))/255;test_x = double(reshape(test_x',28,28,10000))/255;train_y = double(train_y');test_y = double(test_y');%% ex1 Train a 6c-2s-12c-2s Convolutional neural network %will run 1 epoch in about 200 second and get around 11% error. %With 100 epochs you'll get around 1.2% errorrand('state',0)cnn.layers = { struct('type', 'i') %input layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 6, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %sub sampling layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 12, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %subsampling layer};cnn = cnnsetup(cnn, train_x, train_y);opts.alpha = 1;opts.batchsize = 50;opts.numepochs = 1;cnn = cnntrain(cnn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = cnntest(cnn, test_x, test_y);%plot mean squared errorfigure; plot(cnn.rL);assert(er<0.12, 'Too big error');```Example: Neural Networks---------------------```matlabfunction test_example_NNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);% normalize[train_x, mu, sigma] = zscore(train_x);test_x = normalize(test_x, mu, sigma);%% ex1 vanilla neural netrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samples[nn, L] = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.08, 'Too big error');%% ex2 neural net with L2 weight decayrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.weightPenaltyL2 = 1e-4; % L2 weight decayopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex3 neural net with dropoutrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.dropoutFraction = 0.5; % Dropout fraction opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex4 neural net with sigmoid activation functionrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm'; % Sigmoid activation functionnn.learningRate = 1; % Sigm require a lower learning rateopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex5 plotting functionalityrand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]);opts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through datann.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex6 neural net with sigmoid activation and plotting of validation and training error% split training data into training and validation datavx = train_x(1:10000,:);tx = train_x(10001:end,:);vy = train_y(1:10000,:);ty = train_y(10001:end,:);rand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]); nn.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, tx, ty, opts, vx, vy); % nntrain takes validation set as last two arguments (optionally)[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');```[![Bitdeli Badge](https://d2weczhvl823v0.cloudfront.net/rasmusbergpalm/deeplearntoolbox/trend.png)](https://bitdeli.com/free "Bitdeli Badge")

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