利用机器学习对4D fMRI图像进行分类:聚焦计算与内存利用效率
1. 引言
在阿尔茨海默病(AD)分类中,大脑活动通过功能磁共振成像(fMRI)捕获的血氧水平依赖(BOLD)磁化来推导。活跃的大脑区域氧合丰富的血液流量更高,通过氧气与血红蛋白的结合使这些区域具有更强的磁性,从而产生更强的MRI信号。对受试者是否患有阿尔茨海默病(AD)、轻度认知障碍(MCI)或认知正常(CN)的分类,是基于聚合体素BOLD信号强度值的相关性。
fMRI中用于AD分类的体素大小通常为2 - 4毫米,在本研究中,受试者的fMRI数据被映射到分辨率为3.3毫米的MNI - 152脑模板。女性和男性的大脑体积平均分别为1130立方厘米和1260立方厘米,数据集的MNI - 152体素数量在31,000 - 35,000范围内。数据集最多有200个全脑时间样本,每个样本有48个64×64的体素切片,形成一个最多包含3900万个体素强度值的4D数据集,其中最多700万个值代表大脑体素。
许多机器学习(ML)方法通过聚合感兴趣区域(ROI)的体素信号,然后基于体素聚合的ROI - ROI相关性进行分类,来降低分类的计算复杂度。准确定义大脑区域、其功能和连接非常具有挑战性,存在多种用于研究结构和功能的分割方法,如解剖学、功能连接或层次聚类方法,旨在提供不同粒度的有意义分割。本研究使用静息态(RS)fMRI数据来评估功能连接并进行受试者分类,以独特的方式形成ROI,每个ROI的体素平均比使用所有解剖区域体素的方法少5倍,并以独特的方式聚合体素强度值进行ROI - ROI相关性计算。
主要贡献如下:
- 为每个AAL - 90区域定义局部ROI,由遍历MNI - 152脑模板边界框的单