LSF usage

本文介绍了在LSF(LoadSharingFacility)环境下,如何使用bsub命令进行作业调度,包括执行预执行和后执行命令、利用LSB_JOBID环境变量、以及管理组作业、查看队列状态和终止作业的相关操作。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

bsubs

optiondescriptionexample
-ERuns the specified job-based pre-execution command on the execution host before actually running the job.
-EpRuns the specified job-based post-execution command on the execution host after the job finishes.

-eAppends the standard error output of the job to the specified file path.
-ggroup jobbsus -g /group_job_name

demo

前处理和后处理(pre/post execution)

bsub  -E 'echo pre > pre.${LSB_JOBID}.log' -Ep 'echo post > post.${LSB_JOBID}.log' sleep 10

环境变量LSB_JOBID是LSF为每一个作业设置的专有环境变量,内容为作业ID
bsub -o lsf/`date +%Y%m`/%J.out -e lsf/`date +%Y%m`/%J.err

bjobs

-w: 

bqueues

bkill

group

bsub -g /group_job_name

bkill -g /group_job_name 0

获得PID

bsub -q gui -I calibre -drc -batch & pid=$!

获得JOBID

function nk_jobid {
    output=$($*)
    echo $output | head -n1 | cut -d'<' -f2 | cut -d'>' -f1
}

jobid=$(nk_jobid bsub pwd)

03-14
### IBM LSF 集群管理与作业调度系统使用指南 #### 1. 系统概述 IBM Spectrum LSF (Load Sharing Facility, LSF) 是一种强大的分布式计算环境管理和工作负载自动化平台。它支持高性能计算 (HPC),并能有效分配资源以优化性能和利用率[^1]。 #### 2. 安装与配置 安装 IBM Spectrum LSF 的过程通常涉及以下几个方面: - **服务器端设置**:需要定义主服务器以及备用服务器的角色,确保高可用性和冗余。 - **客户端配置**:每个节点都需要正确配置以便连接到中央队列管理系统。 - **网络通信调整**:为了减少延迟并提升吞吐量,应仔细规划网络拓扑结构及其参数设定[^3]。 #### 3. 工作流提交与控制 用户可以通过命令行或者图形化界面来提交任务至 LSF 调度器中处理。常用的一些操作包括但不限于: ```bash bsub < job_script.sh # 提交脚本文件作为新任务进入等待列表 bjobs # 查看当前正在运行或排队中的所有作业状态 canceljob JOB_ID # 终止指定 ID 对应的任务实例 ``` #### 4. 性能调优建议 对于希望进一步改善其 HPC 基础设施表现的企业来说,可以考虑采用如下策略之一来进行微调: - 利用内置报表功能分析历史数据找出潜在瓶颈所在位置; - 实施动态优先级机制让重要项目获得更快响应速度; - 结合 GPFS 文件系统解决可能出现的大规模读写竞争问题[^2]; #### 5. 日常维护技巧 保持整个系统的健康运转还需要定期执行一些预防性的措施比如更新补丁版本号、备份关键数据库记录等等。此外还可以借助于专门开发出来的RTM(Real Time Monitor)组件来做更深入细致的状态跟踪和服务质量评估。 ```python import subprocess def submit_job(script_path): result = subprocess.run(['bsub', '<', script_path], capture_output=True, text=True) if 'Job' in result.stdout: print(f'Successfully submitted {script_path}') else: raise Exception('Failed to submit job') submit_job('/path/to/your/script.sh') ```
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