nii批量压缩为nii.gz

最新推荐文章于 2025-05-08 17:08:11 发布
原创 最新推荐文章于 2025-05-08 17:08:11 发布 · 3.1k 阅读 · 6 ·
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博客介绍了使用gzip命令压缩全部nii文件的方法，输入“gzip *”即可完成压缩操作。

gzip *
即可压缩全部nii文件

nii格式和nii.gz格式详解
行走
05-12 3万+
文章目录nii基础hdr/headerExtensionImage坐标体素转换矩阵转换矩阵内部参数概念转换矩阵组成转换矩阵应用nii格式 nii基础 大部分医学领域导出dicom格式，但是太复杂了。很多时候，将dicom转换为nifti格式也就是nii格式。 一个NIFTI格式主要包含三部分：hdr,ext,img。 hdr/header 这部分数据长度是固定的，当然不同版本可能规定的长度不同，但是同一版本的多个nii文件是相同的。 header里包含的信息有： 维度，x,y,z，单位是毫米。还有第四个
dcm文件批量转换为nii.gz文件
m0_65173448的博客
07-09 820
【代码】dcm文件批量转换为nii.gz文件。
批量转换nii文件为nii.gz格式
SaBo‘s Blog
04-09 3986
1. 使用工具MATLAB 在nii文件的文件夹下打开matlab命令行，输入代码片段。 gzip('*.nii')
Ubuntu安装Pycharm并添加系统快捷启动图标
追求卓越583的博客
10-22 1062
首先，在桌面创建一个文件：pycharm.desktop 编辑这个文件，添加以下内容（Exec是sh文件位置，icon是图标文件位置）： [Desktop Entry] Version=1.0 Type=Application Name=Pycharm Icon=/home/du/Documents/pycharm-community-2017.3.3/bin/pycharm.png Exec=/home/du/Documents/pycharm-community-2017.3.3/bin
批量对.nii.gz文件进行解压操作,并保存，成功转换成.nii文件
qq_44504069的博客
02-17 2976
批量对.nii.gz文件进行解压操作,并保存，成功转换成.nii文件 niigz2nii
【转换数据集格式】dcm转nii，mhd转nii，nii转nii.gz,nrrd转nii，jpg转png，将图像打patches块，
cvxiayixiao的博客
10-24 2054
😳装包🍉 博主微信🍓 【Segment Anything Model】计算机视觉检测分割任务专栏。🍑 【公开数据集预处理】特别是医疗公开数据集的接受和预处理，提供代码讲解。🍈 【opencv+图像处理】opencv代码库讲解，结合图像处理知识，不仅仅是调库。【opencv+图像处理】专栏代码地址。
读取nii或nii.gz文件中的信息即输出图像
热门推荐
Begining
06-12 1万+
读取nii或者nii.gz文件中的信息，并且输出图像。 import matplotlib from matplotlib import pylab as plt import nibabel as nib from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D file = '' #你的nii或者nii.gz文件路径 img = nib.load(file...
如何批量把影像数据DICOM转化为nii.gz
小马影像的博客
04-14 3851
批量转换DICOM文件为nii.gz格式批量把影像数据DICOM转化为nii.gz如何插入一段漂亮的代码片导入 批量把影像数据DICOM转化为nii.gz 如何插入一段漂亮的代码片 去博客设置页面，选择一款你喜欢的代码片高亮样式，下面展示同样高亮的 代码片. // An highlighted block Path = '/home/deeplearning/Images/' #DICOM存放的文件夹 for i in range(101): #文件个数，我这里是100个 # "文件"+
批量转换nii.gz文件为nii格式
10-18
批量转换.nii.gz（压缩版的NIFTI文件）为.nii（未压缩格式）通常涉及到解压并重新保存原始数据。这个过程可以用一些通用的编程语言（如Python）或者特定的图像处理工具来完成，比如FSL（FMRIB Software Library）、...
编写一段代码，使nii文件转换为nii.gz
02-20
| 适用场景 | 需要验证数据完整性的转换 | 快速批量压缩 | --- ### 使用步骤 1. **安装依赖**（仅方法一需要）： ```bash pip install nibabel ``` 2. **选择方法**： - 需要保留原始文件 → 使用方法一...
ITK 实现多张图像转成单个nii.gz或mha文件案例
12-17
主要实现的部分是利用NameGeneratorType读入系列图像，见头文件#include “itkNumericSeriesFileNames.h”。 需要包含的头文件有： #include "itkImage.h" #include "itkImageSeriesReader.h" #include "itkImageFileWriter.h" #include "itkNumericSeriesFileNames.h" #include "itkPNGImageIO.h"//转成JPG格式，将PNG替换成JPEG就可以。 int main( int argc, char ** arg
问题 1 ： 图像 1.nii.gz ( ( 999, 828, 1, 1, 3 ) ) 和 Mask 1.nii.gz ( ( 999, 828, 1 ) ) 的尺寸不匹配问题 2 ： 图像 1.nii.gz 和 Mask 1.nii.gz 不是 2D 怎么解决
04-22
好的，我现在需要解决用户的问题，即如何处理nii.gz格式的图像文件和Mask文件尺寸不匹配的问题，并将它们转换为2D格式。首先，我需要理解用户提到的具体尺寸问题。用户给出的图像尺寸是(999, 828, 1, 1, 3)，而Mask...
nii转换为mhd
mvpboy123的博客
09-06 689
import SimpleITK as sitk import numpy as np import os from batchgenerators.utilities.file_and_folder_operations import * def nii2mhd(file_path): itk_img = sitk.ReadImage(file_path) save_path = file_path.strip(’.gz’).strip(’.nii’)+’.mhd’ sitk.WriteImage(itk
nii文件转换方向
zhangjipinggom的博客
02-28 4494
1. 我想把RPI转成RAI 2. 方案（目前测试行不通） import nibabel as nib import numpy as np def compute_orientation(init_axcodes, final_axcodes): """ A thin wrapper around ``nib.orientations.ornt_transform`` :param init_axcodes: Initial orientation codes
简单说明.nii.gz文件数据结构
最新发布
weixin_45805339的博客
05-08 1263
NIfTI（Neuroimaging Informatics Technology Initiative）的.nii.gz文件是医学影像领域（如MRI、CT等）广泛使用的数据格式，其本质是NIfTI格式文件（.nii）通过gzip压缩后的版本。
nii与nii.gz格式的关系
qq_25359437的博客
12-23 1万+
nii与nii.gz格式的关系 标准NIfTI图像的扩展名是.nii，包含了头文件及图像资料。由于NIfTI格式和Analyze格式的关系，因此NIfTI格式也可使用独立的图像文件[.img]和头文件[.hdr]。单独的.nii格式文件的优势就是可以用标准的压缩软件[如gzip]，而且一些分析软件包[比如FSL]可以直接读取和写入压缩的.nii文件[扩展名为.nii.gz]。 简而言之，nii格式...
医学图像格式转换 -- .dcm转为.nii.gz
weixin_40051325的博客
02-25 1万+
注： 代码主要根据 dcm2nii.多张dcm 文件转换成nii等其他格式的存储。 进行函数整合，感谢原作者！ #coding=utf-8 import SimpleITK as sitk def dcm2nii(dcms_path, nii_path): # 构建dicom序列文件阅读器，并执行（即将dicom序列文件“打包整合”） reader = sitk.ImageSeriesReader() dicom_names = reader.GetGDCMSeriesFileName
sitk三维体数据与二维切片互转（nii.gz转dcm和dcm转nii.gz）
u010409517的博客
12-13 6389
在对医学图像数据进行处理时，通常我们会将原始的dicom序列转换为三维的体数据nii.gz格式，便于后序的处理。处理完后，可能又要转换为一张张dicom切片。其实使用sitk对nii.gz和dcm进行互转非常方便，几行代码就能搞定。 dcm转nii.gz file_path = './lung_img' #dicom存放文件夹 series_IDs = sitk.ImageSeriesReader.GetGDCMSeriesIDs(file_path) series_file_names = sitk.
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