生物信息
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AlphaFold2预测结构能否直接用于虚拟筛选？
虽然AlphaFold2能够预测出较为精确的蛋白骨架结构，但将其直接作为蛋白受体结构进行分子对接结果并不十分理想。但是，通过去除AlphaFold2预测结构中的低置信区域或使用柔性对接方法针对关键侧链添加柔性等，有助于改善对接结果。AlphaFold2预测结构相较于 apo 结构做对接更准确。原创 2024-01-18 16:40:34 · 1612 阅读 · 0 评论 -
AlphaFold更新了！AlphaFold-latest
🔈：号外号外！联合在2023年10月31日发布了新一代的AlphaFold（显着提高了准确性和覆盖范围，主要包括了抗体结合结构预测、蛋白质-核酸复合物结构预测、小分子-蛋白结构预测和蛋白质残基的修饰结构预测等方面的重大更新，为加速生物医药研究开辟了全新的可能性。原创 2023-11-02 10:48:41 · 432 阅读 · 1 评论 -
AlphaFold-multimer 复合物结构预测
是DeepMind开发的AlphaFold项目的一个扩展，旨在预测蛋白质多聚体的三维结构。蛋白质多聚体是由多个蛋白质亚单位相互组装而成的结构，如酶、膜蛋白复合物和病毒颗粒。理解多聚体的结构对于揭示蛋白质的功能和相互作用非常重要。原创 2023-10-17 16:54:52 · 3528 阅读 · 1 评论 -
分子对接软件简介-2023
分子对接（Molecular Docking）是分子模拟的重要方法之一，其本质是两个或多个分子之间的识别过程，其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。这项技术在药物研发、生物医学研究和药物设计中具有广泛的应用，可以帮助科学家理解分子如何相互作用，从而更好地设计和优化药物分子，以提高药物的疗效和选择性。原创 2023-09-18 17:01:18 · 7748 阅读 · 1 评论 -
KEGG信号通路富集分析
当我们手头有转录组测序后的差异分析数据后，想更进一步的去分析这些差异基因在信号通路富集情况，其中一种办法是使用KEGG网站进行信号通路富集分析。原创 2022-11-16 16:47:54 · 21684 阅读 · 0 评论