8. 基础知识
此部分描述了如何使用 LAMMPS 为用户和开发人员执行各种任务。术语表页面还列出了 MD 术语,以及相应 LAMMPS 手册页的链接。 LAMMPS 源代码分发的 examples
目录中包含的示例输入脚本以及示例脚本页面上突出显示的示例输入脚本还展示了如何设置和运行各种模拟。
8.1.通用基础知识
8.2. 设置入门
8.3. 分析入门
8.4. 力场入门
8.4.1. CHARMM、AMBER、COMPASS 和 DREIDING 力场
8.4.2. AMOEBA 和 HIPPO 力场
AMOEBA 和 HIPPO 极化力场是由华盛顿大学圣路易斯分校的 Jay Ponder 团队开发的。 LAMMPS 实现基于 Ponder 小组在其 Tinker MD software软件中提供的 Fortran 90 代码。
LAMMPS 中 AMOEBA 的当前实现(2022 年 7 月)与