10、文本和数据文件操作与编辑指南

文本和数据文件操作与编辑指南

在处理文本和数据文件时,掌握一些实用的命令和工具可以大大提高工作效率。本文将介绍一系列用于查看、分析和编辑文本文件的命令和工具,帮助你更好地处理文件。

1. 查看和分析文件
1.1 提取唯一行

在处理文本文件时,有时需要提取唯一的行。例如,从文件中删除重复的基因ID。可以使用 sort 命令结合 -u 选项来实现这一目的,也可以使用 uniq 命令。

示例如下:

$ sort pdbfilelist.txt
1ANF.pdb
1ANK.pdb
1ANK.pdb
1ETN.pdb
2Y1B.pdb
$ sort pdbfilelist.txt | uniq
1ANF.pdb
1ANK.pdb
1ETN.pdb
2Y1B.pdb

uniq 命令要求数据行是排序的,它会将连续的相同内容行替换为一行。

1.2 查看文件开头或结尾

当你有多个文本文件,但记不清它们的内容时,只需查看几行就可能唤起记忆。 head tail 命令可以满足这一需求。 head filename 显示文件的前10行, tail filename 显示文件的后10行。还可以使用 -n 选项指定显示的行数。

示例: <

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