python实现密度聚类算法之OPTICS
OPTICS(Ordering Points To Identify the Clustering Structure)是一种密度聚类算法,与DBSCAN类似,但它能更好地处理不同密度的簇,并能够生成数据集的“可达图”,从而揭示更复杂的聚类结构。下面是一个完整的Python实现,包括详细的注释和示例。
OPTICS算法简介
OPTICS算法的主要步骤包括:
初始化:将所有点标记为未访问。
遍历所有点:对于每个未访问的点,执行深度优先搜索以找到所有密度可达的点。
核心距离和可达距离:
核心距离:给定半径ε,一个点的核心距离是其MinPts-th 最近邻的距离。
可达距离:从某点到其邻居的距离中更大的一个(即最大值)。
构建可达图:记录点的可达距离,依据这些距离对点重新排序,从而形成可达图。
完整的OPTICS实现
下面的代码实现了OPTICS算法的核心功能:
import numpy as np
from collections import deque
from sklearn