inter_peng的专栏

弄了半天，原来和一个分割符，较了好长时间的劲。这还是源于自己对于dicom tag的认识，缺少认识。通过这次脱敏的实现，也补上了这块短板。

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本文由Markdown语法编辑器编辑完成。封面图由豆包AI, 文生图像生成.

本文主要分析, python程序中，使用with...open方式，打开一个较大文件时，内存加载的模式，旨在帮助了解python与文件读写相关的内存管理机制.

1024程序员节｜征文#

在之前的博文中，已经写过如果利用simpleITK, 来生成一个包含一个序列内全部像素信息的.mha文件。这里不再赘述。假设我们已经有一个之前生成好的.mha文件。那么我们首先读取这个.mha文件，看看它除了体数据，还有哪些信息。以下是一段, 基于SimpleITK读取一个已经存在.mha的文件，并且读取它已知的元信息的代码.然后读取这几个Key值时，输出的结果却是UNKNOWN_PRINT_CHARACTERISTICS.

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说实话，之前对DICOM中的PixelRepresentation，这个tag, 有一定的了解，但了解不是很深。直到在实际的应用中，遇到了因为这个tag的值，而引发的问题，才开始准备对它，重新认识一下。由于我们处理的，主要是CT图像。因此，就先从CT图像开始说起。

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了解DICOM的各个tag的VR的不同，对于处理相关的业务具有重要的作用。

本文由Markdown语法编辑器编辑完成.关于3d Slicer的介绍, 在前面的几篇博文中已经有所介绍. 这篇文章主要分享, 在实际的项目开发中的经验.Slicer是由很多很多的Module构成的, 这些Module分别承担了不同的应用场景. 因此, 完成一个比较复杂的操作, 一般需要在不同的Module之间手动切换. 这对于需要批量操作或自动化操作, 就带来了很大的不便.好在, Slicer提供了丰富的接口, 可以通过Python调用底层的接口, 从而实现很多需要手动完成的工作.以下, 首先会列

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本文由Markdown语法编辑器编辑完成。1. 前言2. 3d Slicer的编译介绍2.1 windows 10平台编译2.2 linux(ubuntu 18.04)平台编译

本文由Markdown编辑器编辑而成。1.MIP的定义在前面的技术调研中，已经对MPR(多平面重建)的原理及其在ParaView中的实现进行了基本的介绍。MPR最常用来检查脊椎，因为轴切面的影像只限于有时才能显出椎体，也无法完全显示出椎间盘，然后经过影像的重组，医生便可以更容易地观察出脊椎地位置以及其和其他器官的关系。在医学影像的三维影像后处理算法中，除了MPR外，还有一种较为常见的算法，名称为MI

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。基本介绍：vtkVolumeRayCastMIPFunction: A maximum intensity projection ray caster for volumes. vtkVolumeRayCastMIPFunction is a volume ray cast function that computes the maximum value

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。1. 背景：在医疗软件的开发中，QT和VTK是经常配合使用的。基于QT，可以快速地搭建出软件的图像窗口、按钮、工具栏和状态栏；基于VTK(还有DCMTK,ITK等)，则可以实现医学图像的基本读取和处理。VTK的渲染窗口是其内部的一个类vtkRenderWindow，响应鼠标事件是通过vtkRenderWindowInteractor。那么如何实现将基于VTK

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。1. 背景：　　在开发医疗软件的过程中，已经接触了很多开源的Dicom Viewer软件，这些都大公司出品的非商业版软件，如PhilipsDicomViewer，看起来高大上；也有一些很小巧的软件，如ezDicom软件。　　但是以上提到的这几款软件，当然指的是免费版，仅提供了基本的二维阅片功能，暂不支持三维后处理功能。近日在网上浏览关于医学影像处理软件的帖子

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。1. DRR图像的概念　　DRR(Digitally Reconstructured Radiograph)，全称为数字重建放射影像。它是指射野方向或从类似模拟定位机的X射线靶方向观视3D重建图像的结果。近年来，随着计算机技术的发展和CT扫描技术的进步，DRR越来越多的取代了传统CT模拟定位机所用胶片图像。 　　DRR被广泛应用于CT模拟定位、图像引导放射

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。1. 问题提出背景：　　基于本博客之前的一篇博文《QT+VTK: 如何在QT中显示VTK生成的图像》，主要讲解了一般医学软件是如何基于QT和VTK的基础，进行医学图像的渲染和展示的。　　前段时间在实现一个需求——在一个窗口中显示一个序列的部分图像。这就需要在QT的一个布局窗口（QWidget/QLayout）中，再内建一个QGridLayout，然后将序列图

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。1. 定位线的概念和意义　　随着医学成像技术的不断发展，计算机断层扫描(CT)和核磁共振成像(MRI)已经越来越多地应用在了相关疾病的诊断中。医生通过分析病人器官的CT/MR序列的二维切片图像，可以大致观察到患者病灶的大小及形状。但是由于一个序列的二维切片影像较多，且同一个患者的不同序列影像可以反映不同视角的病灶信息。如常用的轴、矢和冠状位就反映了人体的从头

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。1. ORS Visual软件简介：2. C/S模式The most logical choice to meet any medical imaging challenge. ORS Visual是满足任何医学影像工作挑战的最合理的选择. ORS Visual offers a full suite of advanced 3D visualizati

本文档由Markdown语法编辑器编辑完成。1. OsiriX 简介：OsiriX软件是一款世界著名的Dicom Viewer软件。OsiriX MD, the medical edition of OsiriX, is certified and validate for clinical use in medicine(FDA, CE, ANVISA). With ultrafast perfo

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。前言：已知用pydicom读取一类Dicom图像时会报错，报错信息大致如下： OSError: cannot identify image file <_io.BytesIO object at 0x107683728> During handling of the above exception, another exception occured:

本文由Markdown语法编辑器编辑完成．1. 开源PACS服务＿dcm4chee：2. 基于dcm4chee docker镜像，启动PACS服务3. 基于dcmtk，进行dcm医学图像的传输测试

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。1. 医学影像与三维可视化2. 面绘制和体绘制的实现原理2.1 面绘制 (Surface Rendering)　　VTK中基于面绘制实现三维重建，使用的是经典的Marching Cubes(移动立方体法)算法。 　　 　　面绘制是采用分割技术对一系列的二维图像进行轮廓识别、提取等操作，最终还原出被检测物体的三维模型，并以表面的方式显示出来。　　面绘制的数

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。问题背景：为了实现类似于一款操作STL等3D对象的软件——Geomagic Studio软件在操作其视野中的3D对象时，可以通过工具->移动->高级对象移动器，调出一个包围该3D对象的坐标轴和沿着这三个轴的三个圆圈。这样，在平移和旋转3D对象对象时便非常直观了。如下图所示： 具体的交互方法为： （1）平移：当鼠标落在通过3D对象中心的三根红、绿和蓝轴的任

本文是由Markdown语法编辑器编辑完成。1. CornerStoneCornerSone is a JavaScript library to display interactive medical images including but not limited to DICOM. CornerStone是一个交互式的显示，包括但不限于Dicom格式的医学影像的JavaScript库。

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。随着互联网技术在医疗行业的深入发展，通过浏览器来进行医学影像的浏览、分析和诊断也开始变得越来越流行了。这其实也是云技术在医疗行业的应用之一。试想，无论是医院机构，还是患者本身，不再需要去购买专业的医学影像软件Dicom Viewer，而只需要将拍摄的影像拖动到一个浏览器中，便可以得到和过去专业Dicom Viewer软件相似的服务，那真是非常美好的一件事情。

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。1.关于MITK：MITK的全称是”The Medical Imaging Interaction Toolkit”。它是一款开源的交互式医学图像处理软件开发和应用平台。MITK将ITK和VTK整合为一个应用框架。该软件由德国一个研究室开发。官网地址为：http://mitk.org/wiki/MITK 。与MITK同名的还有另一款由中科院自动化研究所开发的

本文由Markdown语法编辑器编辑完成。上周由于项目的需要，领导安排让我进行VTK的一个小培训。为了这个培训，我也准备了将近三天的时间。通过这三天的准备，我对VTK也有了一个全面的了解。通过给别人分享，然后再一起讨论，这样可以起到更好的学习效果。 回顾这次培训的过程，我在准备ppt的过程中，尽量站在一个接受培训的人员的眼中来准备，把他们最想了解到的知识结构都呈现出来，尽量做到图文并茂，尽量能够以

本文由Markdown编辑器编辑完成。1. 前言：已知在ParaView5.0的Filters列表中暂且还没有实现MPR/MIP功能的filter。为了扩展ParaView的filter，需要用户自己创建相应的Plugins，然后再通过Plugins的管理器将创建的reader,filter等不同类型的plugin增加到ParaView中来。由于ParaView底层是基于VTK实现的，因此如果扩展P

本篇博客由Markdown编辑器编辑而成。1. 前言在之前关于ParaView技术调研中，已经通过修改ParaView5.0的源代码实现了MIP/minIP/aveIP的功能。但是由于对ParaView的代码结构还不是完全了解，至少在目前的了解程度上，还无法做到完全根据自己的实际需要来进行MIP。如我需要将体数据首先在空间中进行一定的旋转和平移后，再进行指定厚度的MIP展现。这个需求在ParaVi

前言： 正如前述文章中提到的，DICOM（Digitial Image Communications in Medicine）是所有从事医学影像处理的工作者需要了解的最基本的图像格式。 假设一个患者到医院就诊，为了判断他的病灶，医生需要指定不同的检查（例如：CT,MR,Ultrasound等），而每一项检查（Study）都需要由相对应的仪器来完成。但是仪器产生的一系列（Series）的影像（I

DICOM 基础知识DICOM是所有从事医学影像处理的工作者需要了解的最基本的图像格式。这里摘抄一篇关于DICOM简介较为详细的文章，我也可以常常浏览，以达到温故而知新的目的。

VTK基础知识储备及example1.     Vtk简介： 参考来源：http://blog.youkuaiyun.com/bingo_gmwu/article/details/4711611Vtk是一个支持三维数据显示和交互的面向对象开发库。Vtk提供的对三维数据的操作是通过一个管道（pipeline）体系实现的，在管道体系中多个元素结合在一起共同完成一个复杂的任务。一个典型的管道结构可以

医学影像Image Orientation1.      Image Orientation:     如之前在博文《DICOM中几个判断图像方向的tag》中提到的ImageOrientation(0020,0037)表示的是图像第一行和第一列相对于病人的方向。而在DICOM坐标系是根据病人的方向来确定的，其中X轴正向指向病人的左侧，Y轴正向指向病人的背部，Z轴正向指向病人的头部。在医