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在RAG(Retrieval-Augmented Generation,检索增强生成)技术中,本地知识库的存储位置和形式需要根据具体需求选择,通常结合向量数据库和结构化数据库来实现高效检索和生成。以下是详细说明和实现方案:
一、RAG技术的核心流程
RAG通过以下步骤将知识库与生成模型结合:
- 输入查询:用户输入问题(如“胸痛可能是什么疾病?”)。
- 向量化查询:将问题转换为向量(如使用BERT)。
- 检索知识库:从本地知识库中检索与查询最相关的文档或片段(如症状描述、医学指南)。
- 生成回答:将检索到的内容与生成模型(如LLaMA、Qwen)结合,生成最终回答。
二、本地知识库的存储形式
1. 向量数据库(核心存储)
- 作用:存储文本向量,用于快速检索与查询最相关的文档。
- 典型工具:
- Faiss:Facebook开源的高效向量索引库,适合本地部署。
- Milvus:专为向量搜索设计的分布式数据库,支持大规模数据。
- Elasticsearch:支持向量搜索,适合混合文本+向量查询。
2. 结构化数据库(元数据存储)
- 作用:存储结构化信息(如文档ID、标题、来源、ICD编码等)。
- 典型工具:
- MySQL/PostgreSQL:存储症状-疾病映射、药物信息等。
- MongoDB:存储非结构化医学指南文档。
3. 混合存储架构
- 典型架构:
深色版本
graph LR A[用户查询] --> B[向量化] B --> C[向量数据库检索] C --> D[结构化数据库查询元数据] D --> E[生成模型] E --> F[最终回答]
三、本地知识库的具体实现方案
1. 向量数据库(Faiss)存储
步骤1:将文本转换为向量
python
深色版本
import numpy as np
from sentence_transformers import SentenceTransformer
model = SentenceTransformer('all-MiniLM-L6-v2') # 使用预训练模型生成向量
# 示例:将症状描述转换为向量
symptoms = [
"胸痛、呼吸困难",
"持续腹泻、呕吐",
"高烧、皮疹"
]
vectors = model.encode(symptoms)
步骤2:构建Faiss索引
python
深色版本
import faiss
# 创建索引(如IVF Flat)
dimension = vectors.shape[1]
index = faiss.IndexIVFFlat(faiss.normalize_L2(faiss.Matrix(vectors)), dimension, nlist=10)
index.train(vectors)
index.add(vectors)
faiss.write_index(index, "symptom_vectors.index") # 保存索引
步骤3:检索相似症状
python
深色版本
# 加载索引
index = faiss.read_index("symptom_vectors.index")
# 查询新症状
query = "胸痛、呼吸急促"
query_vector = model.encode([query])[0]
query_vector = faiss.normalize_L2(query_vector)
# 检索Top-K相似症状
k = 3
distances, indices = index.search(query_vector.reshape(1, -1), k)
similar_symptoms = [symptoms[i] for i in indices[0]]
2. 结构化数据库(MySQL)存储元数据
sql
深色版本
-- 创建症状-疾病映射表
CREATE TABLE symptom_disease (
symptom_id INT PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT,
symptom TEXT,
related_disease TEXT,
icd10_code VARCHAR(10)
);
-- 插入示例数据
INSERT INTO symptom_disease (symptom, related_disease, icd10_code)
VALUES
("胸痛", "心肌梗死", "I21.0"),
("呼吸困难", "肺炎", "J12.9");
3. 集成RAG流程
python
深色版本
def rag_query(query):
# 步骤1:向量化查询
query_vector = model.encode([query])[0]
# 步骤2:向量检索
distances, indices = index.search(query_vector.reshape(1, -1), 3)
relevant_symptoms = [symptoms[i] for i in indices[0]]
# 步骤3:查询结构化数据库获取元数据
conn = mysql.connector.connect(
host="localhost",
user="user",
password="password",
database="medical_knowledge"
)
cursor = conn.cursor()
cursor.execute("SELECT related_disease, icd10_code FROM symptom_disease WHERE symptom IN %s", (tuple(relevant_symptoms),))
results = cursor.fetchall()
# 步骤4:生成回答(示例:简单拼接)
answer = f"相关疾病:{', '.join([row[0] for row in results])}\nICD-10编码:{', '.join([row[1] for row in results])}"
return answer
# 测试查询
print(rag_query("胸痛、呼吸急促"))
四、存储位置选择建议
1. 向量数据库(本地部署)
- 存储位置:
- 向量索引文件(如
symptom_vectors.index
)存储在本地服务器或云服务器的磁盘中。 - 使用Faiss、Milvus等工具直接管理。
- 向量索引文件(如
2. 结构化数据库
- 存储位置:
- MySQL/PostgreSQL部署在本地服务器或云数据库(如AWS RDS)。
- 数据库表存储症状-疾病映射、药物副作用等结构化信息。
3. 混合存储架构示例
组件 | 存储位置/工具 | 数据内容 |
---|---|---|
向量索引 | Faiss本地文件(如symptoms.index ) | 症状描述的向量 |
症状-疾病映射 | MySQL表 | 症状ID、疾病名称、ICD编码 |
医学指南文档 | MongoDB或本地文件系统 | PDF、文本格式的指南全文 |
五、优化与注意事项
1. 向量数据库优化
- 索引类型选择:
- IVF Flat:适合中小规模数据,查询速度快。
- HNSW:适合大规模数据,内存占用低。
- 向量维度:
- 使用小维度(如256维)减少存储开销,但可能影响精度。
2. 数据一致性
- ID关联:
- 向量索引的
symptom_id
需与MySQL的symptom_id
一致。
- 向量索引的
- 更新策略:
- 定期重新构建索引(如每月更新医学指南)。
3. 性能调优
- 缓存热点数据:
- 将高频查询的向量和元数据缓存到内存(如Redis)。
- 分片存储:
- 对超大规模数据使用Milvus的分布式存储。
六、医疗场景中的实际案例
案例:症状-疾病推理系统
- 知识库组成:
- Faiss:存储症状描述的向量(如“胸痛”“呼吸困难”)。
- MySQL:存储症状-疾病映射(如“胸痛→心肌梗死(I21.0)”)。
- 流程:
深色版本
sequenceDiagram User->>RAG系统: "胸痛、呼吸急促" RAG系统->>Faiss: 向量化查询并检索Top症状 Faiss-->>RAG系统: 返回相似症状列表 RAG系统->>MySQL: 查询相关疾病和ICD编码 MySQL-->>RAG系统: 返回疾病名称和编码 RAG系统->>User: "可能疾病:心肌梗死,ICD-10: I21.0"
七、常见问题解答
Q1:如何选择向量数据库?
- Faiss:适合小规模、高性能需求(如单机部署)。
- Milvus:适合大规模、分布式场景(如10万+向量)。
- Elasticsearch:适合混合文本+向量查询(如同时检索“症状”和“药物名称”)。
Q2:能否用MySQL直接存储向量?
- 可以,但不推荐:
- MySQL不支持向量索引,查询效率低(需遍历计算距离)。
- 向量数据存储在Faiss,元数据存储在MySQL是更优解。
Q3:如何处理隐私数据?
- 脱敏存储:
- 症状描述脱敏(如“患者X描述胸痛”→“胸痛”)。
- 遵循HIPAA或GDPR要求,加密存储敏感数据。