RAG+知识库

目录

一、RAG技术的核心流程

二、本地知识库的存储形式

1. 向量数据库(核心存储)

2. 结构化数据库(元数据存储)

3. 混合存储架构

三、本地知识库的具体实现方案

1. 向量数据库(Faiss)存储

步骤1:将文本转换为向量

步骤2:构建Faiss索引

步骤3:检索相似症状

2. 结构化数据库(MySQL)存储元数据

3. 集成RAG流程

四、存储位置选择建议

1. 向量数据库(本地部署)

2. 结构化数据库

3. 混合存储架构示例

五、优化与注意事项

1. 向量数据库优化

2. 数据一致性

3. 性能调优

六、医疗场景中的实际案例

案例:症状-疾病推理系统

七、常见问题解答

Q1:如何选择向量数据库?

Q2:能否用MySQL直接存储向量?

Q3:如何处理隐私数据?


在RAG(Retrieval-Augmented Generation,检索增强生成)技术中,本地知识库的存储位置和形式需要根据具体需求选择,通常结合向量数据库结构化数据库来实现高效检索和生成。以下是详细说明和实现方案:


一、RAG技术的核心流程

RAG通过以下步骤将知识库与生成模型结合:

  1. 输入查询:用户输入问题(如“胸痛可能是什么疾病?”)。
  2. 向量化查询:将问题转换为向量(如使用BERT)。
  3. 检索知识库:从本地知识库中检索与查询最相关的文档或片段(如症状描述、医学指南)。
  4. 生成回答:将检索到的内容与生成模型(如LLaMA、Qwen)结合,生成最终回答。

二、本地知识库的存储形式

1. 向量数据库(核心存储)
  • 作用:存储文本向量,用于快速检索与查询最相关的文档。
  • 典型工具
    • Faiss:Facebook开源的高效向量索引库,适合本地部署。
    • Milvus:专为向量搜索设计的分布式数据库,支持大规模数据。
    • Elasticsearch:支持向量搜索,适合混合文本+向量查询。
2. 结构化数据库(元数据存储)
  • 作用:存储结构化信息(如文档ID、标题、来源、ICD编码等)。
  • 典型工具
    • MySQL/PostgreSQL:存储症状-疾病映射、药物信息等。
    • MongoDB:存储非结构化医学指南文档。
3. 混合存储架构
  • 典型架构
     mermaid 

    深色版本

    graph LR
      A[用户查询] --> B[向量化]
      B --> C[向量数据库检索]
      C --> D[结构化数据库查询元数据]
      D --> E[生成模型]
      E --> F[最终回答]

三、本地知识库的具体实现方案

1. 向量数据库(Faiss)存储
步骤1:将文本转换为向量
 

python

深色版本

import numpy as np
from sentence_transformers import SentenceTransformer

model = SentenceTransformer('all-MiniLM-L6-v2')  # 使用预训练模型生成向量

# 示例:将症状描述转换为向量
symptoms = [
    "胸痛、呼吸困难",
    "持续腹泻、呕吐",
    "高烧、皮疹"
]
vectors = model.encode(symptoms)
步骤2:构建Faiss索引
 

python

深色版本

import faiss

# 创建索引(如IVF Flat)
dimension = vectors.shape[1]
index = faiss.IndexIVFFlat(faiss.normalize_L2(faiss.Matrix(vectors)), dimension, nlist=10)
index.train(vectors)
index.add(vectors)
faiss.write_index(index, "symptom_vectors.index")  # 保存索引
步骤3:检索相似症状
 

python

深色版本

# 加载索引
index = faiss.read_index("symptom_vectors.index")

# 查询新症状
query = "胸痛、呼吸急促"
query_vector = model.encode([query])[0]
query_vector = faiss.normalize_L2(query_vector)

# 检索Top-K相似症状
k = 3
distances, indices = index.search(query_vector.reshape(1, -1), k)
similar_symptoms = [symptoms[i] for i in indices[0]]
2. 结构化数据库(MySQL)存储元数据
 

sql

深色版本

-- 创建症状-疾病映射表
CREATE TABLE symptom_disease (
    symptom_id INT PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT,
    symptom TEXT,
    related_disease TEXT,
    icd10_code VARCHAR(10)
);

-- 插入示例数据
INSERT INTO symptom_disease (symptom, related_disease, icd10_code)
VALUES 
    ("胸痛", "心肌梗死", "I21.0"),
    ("呼吸困难", "肺炎", "J12.9");
3. 集成RAG流程
 

python

深色版本

def rag_query(query):
    # 步骤1:向量化查询
    query_vector = model.encode([query])[0]
    
    # 步骤2:向量检索
    distances, indices = index.search(query_vector.reshape(1, -1), 3)
    relevant_symptoms = [symptoms[i] for i in indices[0]]
    
    # 步骤3:查询结构化数据库获取元数据
    conn = mysql.connector.connect(
        host="localhost",
        user="user",
        password="password",
        database="medical_knowledge"
    )
    cursor = conn.cursor()
    cursor.execute("SELECT related_disease, icd10_code FROM symptom_disease WHERE symptom IN %s", (tuple(relevant_symptoms),))
    results = cursor.fetchall()
    
    # 步骤4:生成回答(示例:简单拼接)
    answer = f"相关疾病:{', '.join([row[0] for row in results])}\nICD-10编码:{', '.join([row[1] for row in results])}"
    
    return answer

# 测试查询
print(rag_query("胸痛、呼吸急促"))

四、存储位置选择建议

1. 向量数据库(本地部署)
  • 存储位置
    • 向量索引文件(如symptom_vectors.index)存储在本地服务器或云服务器的磁盘中。
    • 使用Faiss、Milvus等工具直接管理。
2. 结构化数据库
  • 存储位置
    • MySQL/PostgreSQL部署在本地服务器或云数据库(如AWS RDS)。
    • 数据库表存储症状-疾病映射、药物副作用等结构化信息。
3. 混合存储架构示例
组件存储位置/工具数据内容
向量索引Faiss本地文件(如symptoms.index症状描述的向量
症状-疾病映射MySQL表症状ID、疾病名称、ICD编码
医学指南文档MongoDB或本地文件系统PDF、文本格式的指南全文

五、优化与注意事项

1. 向量数据库优化
  • 索引类型选择
    • IVF Flat:适合中小规模数据,查询速度快。
    • HNSW:适合大规模数据,内存占用低。
  • 向量维度
    • 使用小维度(如256维)减少存储开销,但可能影响精度。
2. 数据一致性
  • ID关联
    • 向量索引的symptom_id需与MySQL的symptom_id一致。
  • 更新策略
    • 定期重新构建索引(如每月更新医学指南)。
3. 性能调优
  • 缓存热点数据
    • 将高频查询的向量和元数据缓存到内存(如Redis)。
  • 分片存储
    • 对超大规模数据使用Milvus的分布式存储。

六、医疗场景中的实际案例

案例:症状-疾病推理系统
  1. 知识库组成
    • Faiss:存储症状描述的向量(如“胸痛”“呼吸困难”)。
    • MySQL:存储症状-疾病映射(如“胸痛→心肌梗死(I21.0)”)。
  2. 流程
     mermaid 

    深色版本

    sequenceDiagram
      User->>RAG系统: "胸痛、呼吸急促"
      RAG系统->>Faiss: 向量化查询并检索Top症状
      Faiss-->>RAG系统: 返回相似症状列表
      RAG系统->>MySQL: 查询相关疾病和ICD编码
      MySQL-->>RAG系统: 返回疾病名称和编码
      RAG系统->>User: "可能疾病:心肌梗死,ICD-10: I21.0"

七、常见问题解答

Q1:如何选择向量数据库?
  • Faiss:适合小规模、高性能需求(如单机部署)。
  • Milvus:适合大规模、分布式场景(如10万+向量)。
  • Elasticsearch:适合混合文本+向量查询(如同时检索“症状”和“药物名称”)。
Q2:能否用MySQL直接存储向量?
  • 可以,但不推荐
    • MySQL不支持向量索引,查询效率低(需遍历计算距离)。
    • 向量数据存储在Faiss,元数据存储在MySQL是更优解。
Q3:如何处理隐私数据?
  • 脱敏存储
    • 症状描述脱敏(如“患者X描述胸痛”→“胸痛”)。
    • 遵循HIPAA或GDPR要求,加密存储敏感数据。
### RAG 检索增强生成与知识图谱的结合实现及应用 #### 1. 结合的意义 RAG(检索增强生成)是一种通过外部数据源来增强生成模型性能的技术,而知识图谱作为一种结构化的语义网络,能够有效地存储和表达实体及其关系。两者的结合可以显著提高信息检索和生成的质量[^3]。 具体来说,知识图谱提供了丰富的结构化信息,这些信息可以帮助RAG更好地理解和生成上下文相关的回复。例如,在医疗领域中,知识图谱中的疾病、药物以及症状之间的关联可以通过RAG被有效利用,从而生成更加精准的回答。 #### 2. 实现方式 以下是几种常见的RAG知识图谱结合的方式: - **基于查询的知识图谱匹配** 在接收到用户的输入后,先通过自然语言处理技术将其转化为可查询的形式,随后在知识图谱中查找最相关的节点或路径作为补充信息。这一过程可以直接影响到后续的语言生成阶段[^2]。 - **融合嵌入向量空间** 将知识图谱中的实体和关系映射至高维连续空间形成嵌入向量,并与文本表示一起训练用于检索的编码器部分。这样做的好处在于使得机器不仅学会如何从纯文本中提取特征,还学会了如何利用知识图谱里的深层含义。 - **多模态联合建模** 对于某些复杂任务如视觉问答(VQA),除了依赖传统的图像描述外还可以引入对应的概念层次结构即知识图谱来进行辅助决策制定。这种方式下,系统不仅要考虑当前看到的内容还要兼顾背后隐藏的知识背景。 #### 3. 应用场景 这种组合具有广泛的应用前景,特别是在那些需要高度精确性和逻辑连贯性的行业里尤为突出: - **智能客服系统** 利用预先构建好的企业内部业务流程及相关术语构成的知识库配合上先进的对话管理框架共同打造出新一代全天候在线解答各类咨询请求的服务平台[^1]。 - **教育科技产品开发** 面对学生提出的各种学术难题时, 可以快速定位知识点并给出权威解释的同时还能推荐相似题目供练习巩固所学成果。 - **生物医药研究支持工具建设** 帮助科研人员高效筛选海量文献资料找出潜在治疗靶点或者预测化合物活性趋势等等。 ```python from langchain import KnowledgeGraphRetriever, LLMChain from transformers import pipeline # 初始化知识图谱检索器 kg_retriever = KnowledgeGraphRetriever() # 加载预训练语言模型管道 nlp_pipeline = pipeline('text-generation') def rag_with_kg(query): # 使用KG Retriever获取相关实体和关系 kg_results = kg_retriever.retrieve(query) # 构造包含额外KG信息的新提示给LLM Chain enriched_query = f"{query} with context {kg_results}" result = nlp_pipeline(enriched_query)[0]['generated_text'] return result ``` 上述代码片段展示了如何简单地集成一个基本版本的带有知识图谱增强功能的RAG工作流。 ---
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