解决samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file

今天在进行bwa -mem比对时，出现以下情况：

samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory

通过细读报错，发现可能是libcrypto出现了问题

解决步骤：

# 找到Samtools的安装位置
which samtools  #我的位置于~/miniconda3/bin/samtools

进入lib，发现并查看是否有libcrypto.so.1.1，并建立软连接：

# 进入lib
cd /root/anaconda3/lib
ls
 
# 建立软连接
ln -s libcrypto.so.1.1 libcrypto.so.1.0.0

问题成功解决！

补充知识：

Linux 下的链接

作为的一个 Linux 的使用者，Linux 系统下提供 ln 指令来进行文件链接，我们一定见过类似如下指令：

ln -s bar.txt foo.txt

此时如果 ls 查看当前目录下的文件的话，会发现：

ll
total 1.2M
-rw-rw-r--. 1 Nova Nova    0 Aug 11 14:43  bar.txt
lrwxrwxrwx. 1 Nova Nova    7 Aug 11 14:43  foo.txt -> bar.txt

那么这个foo.txt究竟是什么呢？

这个就是一个文件链接，文件链接主要分为硬链接和软链接，通过查看ln --help，可以看到一些重要的内容：

 Desktop ln --help
Usage: ln [OPTION]... [-T] TARGET LINK_NAME
Create hard links by default, symbolic links with --symbolic.

Mandatory arguments to long options are mandatory for short options too.
  -s, --symbolic              make symbolic links instead of hard links

ln 指令默认创建的是硬链接，如果加入了-s参数，则会生成一个软链接。

硬链接：

在 Linux 中，多个文件名指向同一索引节点是存在的，所以硬连接指通过索引节点来进行的连接，即每一个硬链接都是一个指向对应区域的文件。

我们这里创建一个文件foo.txt然后建立一个它的硬链接看看：

vim foo.txt 
➜  cat foo.txt 
LeetCode
➜  ln foo.txt bar.txt # 这一步是用来创建硬链接
➜  ls -li
total 6552
6817859 -rw-rw-r--. 2 Nova Nova       9 Sep 19 15:59 bar.txt
6817859 -rw-rw-r--. 2 Nova Nova       9 Sep 19 15:59 foo.txt

前面的6817859是文件的 inode，可以简单把它想成 C 语言中的指针，它指向了物理硬盘的一个区块，事实上文件系统会维护一个引用计数，只要有文件指向这个区块，它就不会从硬盘上消失，这里我们会发现，这两个文件拥有相同的 inode，通过查看文件内容也会发现是同一个文件：

硬链接的作用是允许一个文件拥有多个有效路径名，这样用户就可以建立硬链接到重要文件,以防止“误删”的功能，由于对应该目录的索引节点有一个以上的连接，假设我们删除了原始的foo.txt文件：

软连接：

软链接又叫符号链接，这个文件包含了另一个文件的路径名，例如在上图中，foo.txt 就是 bar.txt 的软连接，bar.txt 是实际的文件，foo.txt包含的是对于 bar.txt 的 inode 的记录。

软连接可以是任意文件或目录，可以链接不同文件系统的文件，在对符号文件进行读或写操作的时候，系统会自动把该操作转换为对源文件的操作，但删除链接文件时，系统仅仅删除链接文件，而不删除源文件本身，这一点类似于 Windows 操作系统下的快捷方式。