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生信学习小达人
本人专注于学习和记录自己学习生信分析过程中的知识点和报错后解决方法
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公共数据库NCBI下载转录组数据
转录组数据的下载原创 2024-08-20 16:50:02 · 2879 阅读 · 0 评论 -
常用生物信息学格式介绍(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3、bed、sam、bam、vcf)
6. CIGAR CIGAR 字符串，即比对的详细情况，简要比对信息表达式（Compact Idiosyncratic Gapped Alignment Report），其以参考序列为基础，使用数字加字母表示比对结果，比如3S6M1P1I4M，前三个碱基被剪切去除了，然后6个比对上了，然后打开了一 个缺口，有一个碱基插入，最后是4个比对上了，是按照顺序的；则对应的测序质量分数为0，表示测序质量低。bam格式中的b是binary的意思，是sam格式的二进制表示方式，为什么要用二进制表示呢？转载 2023-10-16 16:41:37 · 4298 阅读 · 0 评论 -
ncbi-genome-download批量下载基因组数据
ncbi-genome-download原创 2023-10-11 13:28:50 · 8440 阅读 · 1 评论 -
生物数据下载
数据下载原创 2023-06-28 20:58:57 · 2243 阅读 · 0 评论