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Java JDK安装和环境配置

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结果报错，显示samtools不是一个目录，由于自己 samtools 是利用conda自动安装的。点击其release，下载最新版本v0.4.1(CNVnator_v0.4.1.zip)CNVvator软件比较难安装，其依赖root软件等。首先下载Samtools和hislib软件。, 选择下列Ubuntu 20版本。##安装依赖包samtools。root 的下载地址。

lumpy

由于删除了旧版本的conda，但是 bashrc文件中miniconda/ll/bin仍然配置在环境中，所以会报错，故需将.conda和。condarc文件删除，重新配置镜像。显示 miniconda3 文件夹已存在 （因为安装时会默认安装至此目录，如果此目录已经存在则会冲突报错），此时需将此文件夹重命名或者删除。报错，环境创建不成功。

选择免费版下载,免费版不仅提供了安装版，还提供了免安装的绿色版。5、点击YES,保存登录密码，下次登录就不需要再输入登录密码了。2、选中需要上传的文件后，点击“打开”即可上传文件到服务器。3、输入服务器ip、用户名、端口号，点击ok连接。4、更改安装路径后，选择next。6、点击finish完成软件安装。2、点击使用SSH方式连接服务器。5、点击install进行安装。4、输入服务器登录密码，回车。6、输入密码后，记录并保存。3、选择同意、next。1、点击Session。

picard