在神经科学实验中,脑立体定位技术是精准定位脑区、完成注射、刺激或记录等操作的关键。而坐标的准确获取直接决定了实验的成功率。本文总结了脑立体定位坐标查找的 3 个核心要点,帮助研究者高效定位目标脑区。
一、文献坐标:明确基准是关键
在查阅前人研究时,文献中提及的坐标往往是实验设计的重要参考,但需特别注意坐标的基准定义,避免因理解偏差导致定位错误。
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“from brain surface”:以脑表面为起点
若文献中明确标注坐标 “from brain surface”(距脑表面深度),则 Z 轴深度的计算基准为暴露的脑膜或脑表面。这种情况下,实际操作中需先暴露目标脑区对应的颅骨,去除颅骨和脑膜后,以暴露的脑表面作为 Z 轴零点,直接按照文献数值调整微量注射泵或电极的深度即可。需注意,不同脑区的脑表面高度可能存在差异,操作时需确保颅骨去除范围足够,避免因局部颅骨残留影响脑表面的准确判断。 -
“relative to bregma”:以 bregma 点为零点
若文献标注 “relative to bregma”(相对于 bregma 点),或未特别说明基准但直接给出坐标,则默认以颅骨上的 bregma 点(前囟,颅骨缝的交汇点)作为三维坐标的零点(X、Y 轴以 bregma 为原点,Z 轴以 bregma 所在平面为零点)。此时 Z 轴深度为从 bregma 平面到目标脑区的垂直距离,需结合颅骨厚度进行调整(通常需先去除颅骨,再根据脑区位置计算实际进针深度)。
二、经典图谱:《Paxinos and Watson》图谱的规范应用
对于大小鼠脑立体定位实验,《Paxinos and Watson – The Rat Brain in Stereotaxic Coordinates》(以下简称 Paxinos 图谱)是公认的 “金标准”,堪称神经科学研究者的 “新华字典”。
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图谱核心特性
该图谱包含 160 张高精度冠状切片,覆盖从嗅球到延髓

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