itol.toolkit —— 交互式生命树(iTOL)的辅助工具包
itol.toolkit 是一个开源项目,旨在为 Interactive Tree Of Life(iTOL)提供一个 R 语言编写的辅助工具包。该工具包通过自动化生成注释文件,加快了与 iTOL 的交互过程。
1. 项目基础介绍与主要编程语言
该项目基于 R 语言开发,提供了一个易于使用的接口,帮助用户创建和管理 iTOL 的各种主题和模板。itol.toolkit 利用 R 语言强大的数据处理能力,让用户可以更加高效地处理和可视化复杂的树状结构数据。
2. 项目的核心功能
itol.toolkit 的核心功能包括:
- 支持 iTOL v6 的全部 114 种主题和 23 种模板类型。
- 高通量生成模板,仅需一条命令即可完成。
- 学习已发布的模板主题并加以利用。
- 保存所有可复现的数据于本地,确保结果的可重复性。
3. 项目最近更新的功能
项目最近更新的功能包括:
- 修复了在简单条形图模板中无意义的警告。
- 修复了当热图输入包含单一列时的聚类错误。
- 增加了支持同时输出 Hub 的树状结构。
- 修复了在使用加号操作符与热图单元时出现的错误。
- 增加了颜色排序算法,支持自定义根颜色。
- 新增了两种基于字符串向量以及数据框行列名称的树构建方法。
通过这些更新,itol.toolkit 进一步提升了用户体验和数据处理能力,为生物信息学领域的树状结构可视化提供了更加高效和灵活的工具。
创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考