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Seurat:单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)数据分析和可视化
拿到数据,不知道如何快速地分析?
面对结果,不知道用什么图更好地展示心中的想法?
面对 CNS 期刊优雅的图,心中满是羡慕却不知从何下手?
搜索了很多教程,却在安装时就被繁杂的安装步骤以及满屏的版本冲突劝退?
众所周知,精美的图能让你的高质量期刊论文更上一层楼。为此,我们整理了一系列精美的作图教程,并配套了每一个教程所对应的环境,让你不但能轻松分析数据,还能一键出图!
GOplot:画出差异表达基因富集结果
Notebook 链接:GOplot:把你的差异表达基因富集分析结果画出来!
想象一下,当面对海量基因表达数据时,我们往往需要一个简洁而又生动的方式来讲述数据背后的故事,而基因本体(Gene Ontology)分类往往是一种很好的方式。GOplot 提供了一系列绘图函数,以一组来自脑和心脏内皮细胞的转录组数据(Gene Expression Omnibus,存取号:GSE47067)为例,带你从总体概览逐步深入到特定基因和术语的子集,经过统计分析快速找到数据中的模式和关联性。