Swin-Unet: Unet-like Pure Transformer forMedical Image Segmentation

博客给出了链接https://arxiv.org/abs/2105.05537 ,并表明这是一个2D图像网络相关内容。

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<think>好的,我现在需要处理用户关于Swin-UNet数据集和资源的问题。用户提到了Swin UNETR,根据引用[1],Swin UNETR是原始UNETR的修改版,使用Swin Transformer作为编码器。用户现在想找相关的数据集或示例数据源,特别是下载链接。 首先,我应该回忆Swin-UNet相关的论文或项目,看看他们使用了哪些数据集。Swin-UNet最初可能是在医学图像分割任务中应用的,比如Synapse多器官分割数据集。这个数据集在多个医学影像分割论文中被提到过,包括TransUNet等。引用[2]中的例子来自波茨坦数据集,但那个看起来像是遥感图像分割,可能和用户的需求不符,不过用户可能也需要其他类型的数据集。 接下来,我需要确认是否有公开可用的数据集链接。比如Synapse数据集通常需要从官方网站申请,可能需要填写表格才能获取。另外,医学影像常用的数据集还有BraTS(脑肿瘤分割)、ACDC(心脏分割)等。此外,Swin-UNETR的GitHub仓库可能有示例数据或指导,用户可能需要检查他们的代码库。 用户可能需要具体的下载链接,但有些数据集不能直接下载,需要申请权限。比如Synapse数据集(MICCAI 2015 Multi-Atlas Abdomen Labeling Challenge)可能需要通过他们的网站申请。BraTS数据集可以在Synapse平台或特定比赛页面找到。 另外,Swin-UNet的GitHub页面可能提供预处理过的数据链接或示例数据。比如作者可能使用了一些公开数据集,并在他们的代码库中给出数据准备的说明。所以建议用户查看官方仓库的文档部分。 还需要考虑用户可能需要的资源类型,比如预训练模型、代码示例等,这些通常在GitHub上提供。例如,Swin-UNETR的官方仓库可能有数据加载的脚本或配置文件的示例,指导如何组织数据。 总结可能的步骤: 1. 检查Swin-UNetSwin UNETR的原始论文,确认使用的数据集。 2. 查找这些数据集的官方获取途径。 3. 提供相关GitHub链接,用户可能在那里找到数据处理指南或示例。 4. 提醒用户某些数据集需要申请或遵守使用协议。 5. 如果示例数据不可直接下载,建议用户参考论文中的实验部分或联系作者。 需要确保回答准确,并引用用户提供的引用内容中的相关信息。例如,引用[1]提到Swin UNETR的结构,引用[2]展示了波茨坦数据集的使用,但用户的问题可能更关注医学影像的数据集,所以可能需要区分不同领域的数据源。 可能的资源包括: - Synapse多器官分割数据集(MICCAI 2015) - BraTS脑肿瘤数据集 - ACDC心脏数据集 - MSD(Medical Segmentation Decathlon) - ADNI(阿尔茨海默病神经成像计划) 每个数据集的具体获取方式不同,需要详细说明。同时,可能需要指出Swin-UNETR在3D医学影像中的应用,所以3D数据集更为相关,如KiTS19(肾脏肿瘤分割)等。 最后,确保回答的结构清晰,分点列出数据集、获取方式、相关资源链接,并添加引用标识。</think>关于Swin-UNet及相关模型的数据集和资源,以下是整理的信息: --- ### 1. **常用医学影像数据集** Swin-UNetSwin UNETR主要应用于3D医学图像分割任务,常用数据集包括: - **Synapse多器官分割数据集** 包含30例腹部CT扫描数据,标注了8个腹部器官(如肝脏、胰腺、脾脏等)。 **获取方式**:需通过[Synapse多器官分割挑战赛页面](https://www.synapse.org/#!Synapse:syn3193805/wiki/217789)注册并申请访问权限[^1]。 - **BraTS(脑肿瘤分割数据集)** 包含多模态MRI脑肿瘤图像,用于胶质瘤分割任务。 **下载链接**:[BraTS 2021数据集](https://www.med.upenn.edu/cbica/brats2021/data.html)。 - **ACDC(心脏MRI分割数据集)** 包含100例心脏MRI扫描,标注左/右心室和心肌。 **下载链接**:[ACDC挑战赛数据](https://www.creatis.insa-lyon.fr/Challenge/acdc/)。 - **MSD(Medical Segmentation Decathlon)** 包含10种不同器官和疾病的3D医学影像数据。 **下载链接**:[MSD官网](http://medicaldecathlon.com/)。 --- ### 2. **Swin-UNet相关资源** - **官方代码与示例数据** Swin UNETR的代码库通常包含数据预处理脚本和示例配置: - [Swin UNETR官方GitHub仓库](https://github.com/Project-MONAI/research-contributions/tree/main/SwinUNETR) 提供BraTS和Synapse数据集的加载示例,需按格式组织数据[^1]。 - **MONAI框架支持** [MONAI](https://github.com/Project-MONAI/MONAI)库集成Swin UNETR模型,支持快速加载公开数据集(如MSD): ```python from monai.apps import DecathlonDataset dataset = DecathlonDataset(root_dir="./data", task="Task01_BrainTumour") ``` --- ### 3. **其他示例数据源** - **KiTS19(肾脏肿瘤分割)** 包含210例肾脏CT扫描,标注肿瘤和肾脏区域。 **下载链接**:[KiTS19官网](https://kits19.grand-challenge.org/data/)。 - **Potsdam数据集(遥感图像分割)** 如引用[2]所述,该数据集用于建筑物和地物分割,可通过[ISPRS官网](https://www.isprs.org/education/benchmarks.aspx)申请[^2]。 --- ### 注意事项 - **数据使用协议**:部分数据集需签署数据使用协议(如ADNI),仅限非商业研究。 - **预处理要求**:Swin-UNet输入需为固定尺寸的3D图像,需参考官方代码进行重采样和归一化。 ---
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