综述| 从肠道菌群”看“癌症

一个基于宏基因组或扩增子序列预测代谢组的工具 - melonnpan 一个基于宏基因组或扩增子序列预测代谢组的工具 - Melonnpan 摘要 菌群代谢组学,特别是在人类肠道中的代谢组学,开始提供一条新的途径来鉴定疾病中的功能和破坏的生态。然而,这些数据的成本很高,很难大规模获得,而扩增子或鸟枪法宏基因组测序数据对于成千上万的人群来说是现成的。在这里,描述了一个计算方法,以预测新的微生物群落中潜在的不可观察的代谢产物,给予一个模型上训练的配对代谢组和宏基因组。还... 阅读详情

从肠道菌群”看“癌症


导读

人类肠道是一个庞大而多样的微生物群落的家园, 由大约1000种细菌组成。肠道菌群与其宿主存在共生关系, 在宿主的营养, 免疫, 代谢中起决定性作用。越来越多的研究揭示了肠道生态失调或一些特殊细菌与各种癌症之间的关联。本文将从三方面讨论:(1)肠道菌群如何诱发癌症(2)粪菌移植(FMT)如何潜在治疗癌症(3)FMT应用在癌症上的安全性

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一图看懂

(1)肠道菌群如何诱发癌症

肠道中的菌群生态失调和某些单个细菌可通过激活致瘤途径、诱导炎症和损伤宿主DNA而诱发癌症或促进癌症发展。如下图所示:
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  • 一些细菌(例如产肠毒素脆弱拟杆菌)拥有或产生特定的蛋白质, 能促进 β-catenin(β-连环蛋白)从 E-cadherin (E-钙黏蛋白)分离, 从而激活参与致癌作用的 β-catenin 信号通路。
  • 肠道生态失调导致细菌衍生的短链脂肪酸生成减少。肠道生态失调通过 Toll 样受体 (TLR) 帮助微生物相关分子模式发挥促炎作用, 增加细胞促炎因子的产生, 从而增加癌变。
  • 除了诱导炎症, 许多细菌还可以通过释放特定代谢物来损伤 DNA , 进而促进癌症进展。比如一些微生物代谢产物可直接或间接损伤宿主DNA, 助长癌变。特殊微生物毒素( CDT 和 colibactin )可直接诱导DNA损伤。此外,肠道细菌还通过多胺, DCA , ROS , RNS 和 H2S 间接损伤
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