染色体的基因顺序遗传图谱

果蝇遗传学研究
最新推荐文章于 2022-06-29 10:57:01 发布
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通过对果蝇的研究，科学家发现了决定眼睛、腹部颜色及翅膀大小的基因，并通过双突变体与正常果蝇的杂交实验，揭示了这些基因在染色体上的相对位置。UG基因与CN基因最为接近，其次是B基因与CN基因，最远的是B基因与UG基因。

1、对果蝇的研究发现，决定眼睛的基因CN、决定腹部色的基因B以及决定翅膀大小的基因UG。

2、有些连锁基因定位在同一染色体的相近部位，越近，两个基因的关联程度越高，在染色体上的距离截止近。

3、将B和UG双突变体果蝇与正常果蝇进行杂交，发现大约有17%的后代是单突变体。将B和CN双突变体果蝇与正常果蝇进行杂交，发现大约有9%的后代是单突变体。将UG和CN双突变体果蝇与正常果蝇进行杂交，发现大约有8%的后代是单突变体。据此可得出染色体的基因顺序，B在CN的一边，而UG在CN的另一边。因为UG和CN是最近的，其次B和CN，最后B和UG

染色体坐标排序的两个方法
Mrrunsen的博客
02-12 847
绘图的时候经常会遇到这个问题，有些NGS软件也会遇到。使用下面的代码模拟数据 pos_df=do.call(rbind,lapply(1:10,function(i){ data.frame(gene=paste0('gene',i,LETTERS), chr=sample(paste0('chr',1:22),26,replace=T), start=sample(1:1000,26)) })) pos_df=pos_df[with(...
50、高效准确地从嘈杂和缺失的基因分型数据构建遗传连锁图谱
最新发布
moon9的博客
08-18 19
本文介绍了一种高效准确地从嘈杂和缺失的基因分型数据中构建遗传连锁图谱的新算法。通过理论分析和实验验证，该算法在数据质量高时能够利用最小生成树方法确定标记的真实顺序，并在处理噪声或缺失数据时表现出优于现有工具的准确性。算法结合了理论洞察和实用优化策略，为生物学研究提供可靠支持。
基因在染色体上位置的表示
格物穷理
11-29 1万+
先指定该基因在哪条染色体上（1-22，X，Y），二十三条染色体形态找到图如下： 然后指定在哪条臂上（每条染色体根据着丝点被分成长臂(q)和短臂（P）） 如上图，每条染色体都有长臂和短臂（尽管有些看起来长的和短的眼看上去很接近），我们就拿1号染色体来具体看下吧。 基因在长臂或短臂上的位置。 用各种染色体显带技术，使染色体沿其长轴显示出明暗或深浅相间的带纹，而每一号染色体都有其独特的带纹，这就构成了每条染色体的带型（band）。 每条显带染色体根据ISCN规定的界标（landma..
先天性遗传 -- 耳前瘘管
weixin_30511107的博客
11-24 435
经常可以看到一些人的耳朵前面皮肤上有一个小孔，从娘胎里生出来就有，有时单耳，有时双耳，以女孩子多见。这些小孔可能一辈子没有什么变化，但有时又会从这些小孔里冒出一点点豆腐渣样的东西，并且经常发炎，红肿疼痛，流出黄黄的脓液，甚至形成脓肿，让人无所适从。这些小孔为什么会这样，它们是怎样来的呢？ 耳前的这种皮肤小孔医学上叫耳前瘘管，由于它是与生俱来的，所以又叫先天性耳前瘘管。它是一种先天...
遗传图谱比较
xxxxx
01-13 4529
​​​### 遗传图谱比较或者遗传图和物理图谱比较今天在Bioinformatics杂志上看到一篇关于遗传图谱之间比较的文章，感觉不错，特介绍如下。题目是：The Genetic Map Comparator: a user-friendly application to display and compare genetic mapsPMID: 28073759 DOI: 10.10
基因家族特征分析 - 染色体定位分析
qq_50637636的博客
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2020.9.2丨遗传图谱基础介绍
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遗传图谱构建与QTL定位利器：MapMarker应用指南
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编辑一个txt文本文件，如实如下 group Chr01 start 0 Glyma.01G014700 1.427800 c 47.200000 Glyma.01G219800 54.913356 end 56.831624 group Chr02 start 0 Glyma.02G144300 14.884017 c 38.100000 end 48.577505 保存为.txt文件，然
python 多行排序，根据染色体号，位置信息排序，升序降序排序
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遇到一个问题是需要将文件按照染色体编号和位置编号进行排序，在shell中我们可以使用sort -V -k2,3 annovar.xls这种方式来进行排序，而在python中如果想要进行多行排序，就需要sort的key参数指定的函数返回一个元组或者列表来进行排序。 现在我们有一个染色体位置文件如下： 如果想要对上述的文件进行排序，那么key函数就可以像下面这样写： def chrome_...
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将群体的遗传图谱构建完成之后，我们得到的是一个excel文件，一堆数据，那么在做工作汇报或者发表文章的时候，我们必须要将数据进行可视化，最传统的方法当然是使用mapchart，我一直也是使用mapchart，其将遗传图谱可视化的效果图如下： 作为一个极度老牌的可视化软件，mapchart的弊端现在已经很明显了。在十几年前，一个群体的分子标记还很少，往往很普遍的情况是只有几百个SSR标记，而现...
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xxxxx
08-28 3594
欢迎使用Markdown编辑器写博客本Markdown编辑器使用StackEdit修改而来，用它写博客，将会带来全新的体验哦： Markdown和扩展Markdown简洁的语法 代码块高亮 图片链接和图片上传 LaTex数学公式 UML序列图和流程图 离线写博客 导入导出Markdown文件 丰富的快捷键 快捷键 加粗 Ctrl + B 斜体 Ctrl + I 引用 Ctrl
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