在linux系统下安装packmol报错

文章讲述了在Ubuntu系统中安装packmol的过程,包括使用gfortran编译器,以及遇到commandnotfound错误后的解决尝试,如检查共享库和路径问题。作者提供了一些可能的解决方案链接,最终成功安装并运行packmol。

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#呀嘿,这次我学聪明了,写一行就保存一次

1.安装packmol(Packmol安装及使用教程 - 知乎 (zhihu.com)),GitHub这里写的很详细了,提供的下载版本包括两种安装包

m3g/packmol: Packmol - Initial configurations for molecular dynamics simulations (github.com)

2.安装packmol的第三步里是默认有gfortran编译器的,如果没有可以根据后面的链接进行下载和安装

Ubuntu上安装:sudo apt-get install gfortran

                          通过命令“gfortran -v”,可以查看gfortran是否安装成功

Linux下安装gcc 、g++ 、gfortran编译器 - zhuzhipeng - 博客园 (cnblogs.com)

我当时的安装(4条消息) 在linux下安装fortran编译器详细教程_linux fortran_与人二三的博客-优快云博客

3.以上都完成后(当时没找到Ubuntu的快捷安装办法,电脑仙女就是在这样一步一步试错过程中熬成婆的),试运行结果报错:

/bin/bash: packmol: command not found

这里我尝试的方法有:

(4条消息) error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: can‘t open shared object file: No such file_YH201467的博客-优快云博客(4条消息) Linux下提示bash:command not found解决方法小结_wangqingchuan92的博客-优快云博客在ubuntu下安装packmol,"Command not found"_百度知道 (baidu.com)

packmol安装问题 - 分子模拟 - 小木虫 - 学术 科研 互动社区 (muchong.com)

可以根据自己的报错情况进行尝试,最后反正我这边是能用了...(只要它工作,就别乱动)

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